14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3802 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_3802  Lipoate-protein ligase A-like protein  100 
 
 
378 aa  749    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0279877  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3819  hypothetical protein  34.27 
 
 
386 aa  169  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0720248  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0931  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.36 
 
 
343 aa  72.4  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000248179  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0642  Lipoate--protein ligase  25.07 
 
 
363 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.336498  normal  0.0925855 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1428  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.57 
 
 
354 aa  53.5  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2206  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.53 
 
 
360 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46351  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0443  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.1 
 
 
530 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2086  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.23 
 
 
344 aa  50.8  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09720  lipoate-protein ligase A  27.99 
 
 
364 aa  46.6  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331543  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2128  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.74 
 
 
372 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2218  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.72 
 
 
349 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  26.02 
 
 
349 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  24.27 
 
 
245 aa  43.9  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4031  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.9 
 
 
349 aa  42.7  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>