25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0233 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1820  Ribosomal protein L39e  100 
 
 		 50 aa  100  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.734043  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0233  Ribosomal protein L39e  100 
 
 		 50 aa  100  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1000  50S ribosomal protein L39e  88 
 
 		 50 aa  90.9  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0828  50S ribosomal protein L39e  82 
 
 		 50 aa  83.2  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00308743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1234  Ribosomal protein L39e  74 
 
 		 50 aa  76.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.477191  normal  0.681248 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0115  50S ribosomal protein L39e  57.14 
 
 		 51 aa  61.2  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1970  50S ribosomal protein L39e  61.7 
 
 		 50 aa  57.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1626  50S ribosomal protein L39e  65.91 
 
 		 51 aa  57.4  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000120847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1480  50S ribosomal protein L39e  59.57 
 
 		 50 aa  56.6  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000000312587  hitchhiker  0.000439629 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1884  50S ribosomal protein L39e  60.87 
 
 		 53 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.225461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0538  50S ribosomal protein L39e  55.32 
 
 		 50 aa  54.7  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00000680547  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1569  50S ribosomal protein L39e  57.14 
 
 		 49 aa  54.3  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0026  Ribosomal protein L39e  55.81 
 
 		 51 aa  50.1  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1325  Ribosomal protein L39e  54.55 
 
 		 51 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.567616  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3018  50S ribosomal protein L39e  48.94 
 
 		 50 aa  47.8  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1264  50S ribosomal protein L39e  47.92 
 
 		 52 aa  47.8  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1164  50S ribosomal protein L39e  50 
 
 		 51 aa  45.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0202  ribosomal protein L39e  57.14 
 
 		 52 aa  44.3  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.768835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1000  ribosomal protein L39e  52.27 
 
 		 51 aa  42.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.527424  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0791  50S ribosomal protein L39e  47.83 
 
 		 51 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.669936  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1159  50S ribosomal protein L39e  47.83 
 
 		 51 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1516  50S ribosomal protein L39e  47.83 
 
 		 51 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.151323  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0457  50S ribosomal protein L39e  50 
 
 		 51 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0986  50S ribosomal protein L39e  52.38 
 
 		 51 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40810  cytosolic large ribosomal subunit  42.22 
 
 		 49 aa  41.2  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.430633  normal  0.0769127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>