18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1264 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1264  50S ribosomal protein L39e  100 
 
 		 52 aa  100  5e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1626  50S ribosomal protein L39e  54.9 
 
 		 51 aa  50.8  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000120847  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1325  Ribosomal protein L39e  49.02 
 
 		 51 aa  49.7  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.567616  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1569  50S ribosomal protein L39e  50 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1000  50S ribosomal protein L39e  47.92 
 
 		 50 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1480  50S ribosomal protein L39e  55.81 
 
 		 50 aa  49.3  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000000312587  hitchhiker  0.000439629 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0538  50S ribosomal protein L39e  53.49 
 
 		 50 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00000680547  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1970  50S ribosomal protein L39e  51.16 
 
 		 50 aa  47.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0828  50S ribosomal protein L39e  47.83 
 
 		 50 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00308743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1234  Ribosomal protein L39e  45.83 
 
 		 50 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.477191  normal  0.681248 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0115  50S ribosomal protein L39e  42.86 
 
 		 51 aa  45.1  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1884  50S ribosomal protein L39e  47.83 
 
 		 53 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.225461 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3018  50S ribosomal protein L39e  48.84 
 
 		 50 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0233  Ribosomal protein L39e  51.28 
 
 		 50 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1820  Ribosomal protein L39e  51.28 
 
 		 50 aa  43.9  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.734043  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0026  Ribosomal protein L39e  39.22 
 
 		 51 aa  43.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02301  conserved hypothetical protein  43.14 
 
 		 51 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.316305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40810  cytosolic large ribosomal subunit  42.86 
 
 		 49 aa  42  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.430633  normal  0.0769127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>