30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0828 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0828  50S ribosomal protein L39e  100 
 
 		 50 aa  100  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00308743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1000  50S ribosomal protein L39e  76 
 
 		 50 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1234  Ribosomal protein L39e  72 
 
 		 50 aa  74.3  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.477191  normal  0.681248 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1820  Ribosomal protein L39e  85 
 
 		 50 aa  70.1  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.734043  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0233  Ribosomal protein L39e  85 
 
 		 50 aa  70.1  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0115  50S ribosomal protein L39e  59.18 
 
 		 51 aa  62.4  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1569  50S ribosomal protein L39e  59.18 
 
 		 49 aa  58.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1480  50S ribosomal protein L39e  60.42 
 
 		 50 aa  59.3  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000000312587  hitchhiker  0.000439629 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1970  50S ribosomal protein L39e  60.42 
 
 		 50 aa  57  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1626  50S ribosomal protein L39e  62.22 
 
 		 51 aa  56.6  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000120847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0538  50S ribosomal protein L39e  54.17 
 
 		 50 aa  54.3  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00000680547  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1884  50S ribosomal protein L39e  58.33 
 
 		 53 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.225461 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0026  Ribosomal protein L39e  56.52 
 
 		 51 aa  52  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1325  Ribosomal protein L39e  54.35 
 
 		 51 aa  51.6  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.567616  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1164  50S ribosomal protein L39e  46.94 
 
 		 51 aa  47.4  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0457  50S ribosomal protein L39e  57.14 
 
 		 51 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0202  ribosomal protein L39e  56.52 
 
 		 52 aa  46.6  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.768835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1264  50S ribosomal protein L39e  47.83 
 
 		 52 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3018  50S ribosomal protein L39e  47.92 
 
 		 50 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1000  ribosomal protein L39e  53.19 
 
 		 51 aa  45.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.527424  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1159  50S ribosomal protein L39e  44.9 
 
 		 51 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1516  50S ribosomal protein L39e  44.9 
 
 		 51 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.151323  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0791  50S ribosomal protein L39e  44.9 
 
 		 51 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.669936  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40810  cytosolic large ribosomal subunit  43.75 
 
 		 49 aa  44.7  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.430633  normal  0.0769127 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0442  50S ribosomal protein L39e  47.83 
 
 		 51 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05700  conserved hypothetical protein  43.75 
 
 		 51 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16125  predicted protein  44.68 
 
 		 50 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22124  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02301  conserved hypothetical protein  39.58 
 
 		 51 aa  41.2  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.316305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1678  50S ribosomal protein L39e  47.83 
 
 		 51 aa  40.8  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0986  50S ribosomal protein L39e  47.83 
 
 		 51 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>