48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2377 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2377  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  655    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246522  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1868  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.41 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.232086 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1501  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.19 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0155973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1460  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.19 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.254902  hitchhiker  0.00000061145 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1392  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.96 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.324906  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1744  putative isomerase rotamase signal peptide protein  25.56 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.608009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3548  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.15 
 
 		 323 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4333  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.52 
 
 		 356 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.356343  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21140  peptidil-prolyl cis-trans isomerase  32.58 
 
 		 332 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0016  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  22.26 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000161985  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1460  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  20.63 
 
 		 325 aa  50.4  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0975  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.97 
 
 		 263 aa  50.4  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0529  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.41 
 
 		 306 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2329  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.91 
 
 		 320 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4469  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.27 
 
 		 354 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4488  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  37.5 
 
 		 354 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.280596  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12160  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.56 
 
 		 495 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000838067  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0300  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.32 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.173321 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0198  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.69 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000154337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0512  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.1 
 
 		 316 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.809225  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0215  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.29 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.750083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7589  putative peptidylprolyl isomerase  32.1 
 
 		 274 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144581 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03412  survival protein surA  37.65 
 
 		 427 aa  47.4  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.621823  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0484  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.05 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1881  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.34 
 
 		 272 aa  47  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0659  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.92 
 
 		 324 aa  47  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3588  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.89 
 
 		 300 aa  46.2  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000961276  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4479  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.62 
 
 		 339 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.369311 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0389  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.77 
 
 		 301 aa  46.2  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.271785  normal  0.87637 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2280  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.03 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1731  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.33 
 
 		 287 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.68228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1920  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.03 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0828208  normal  0.871832 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0200  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.93 
 
 		 433 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1407  peptidyl-prolyl cis-trans isomerse domain-containing protein  35.4 
 
 		 629 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00317502  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1935  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.41 
 
 		 260 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.211427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1912  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.41 
 
 		 260 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6167  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.41 
 
 		 260 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0516  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.25 
 
 		 498 aa  44.3  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644007  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1730  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.07 
 
 		 289 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0549  ferric receptor CfrA  28.67 
 
 		 291 aa  43.9  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.234857  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1477  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.43 
 
 		 300 aa  43.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.218418  normal  0.108463 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2517  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.71 
 
 		 284 aa  43.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5213  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.41 
 
 		 260 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.18959 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1723  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.43 
 
 		 426 aa  43.5  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1755  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.43 
 
 		 300 aa  43.1  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1477  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.43 
 
 		 300 aa  43.1  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.72081 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0141  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.89 
 
 		 310 aa  42.7  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000469336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0602  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  34.48 
 
 		 454 aa  42.7  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0218368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>