37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1369 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1369  Methyltransferase type 11  100 
 
 
370 aa  766    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1270  hypothetical protein  24.53 
 
 
468 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11151  conserved hypothetical protein  26.85 
 
 
445 aa  53.9  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.078552  normal  0.207556 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3270  hypothetical protein  46.81 
 
 
71 aa  50.4  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.731056  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38469  predicted protein  27.51 
 
 
383 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.416523  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2210  protein of unknown function DUF343  41.67 
 
 
68 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.451812  normal  0.154545 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1886  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 
313 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000470548  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5074  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.33 
 
 
252 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1724  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  47.27 
 
 
249 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.335663  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2528  protein of unknown function DUF343  39.58 
 
 
68 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2253  hypothetical protein  39.58 
 
 
68 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.160718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5673  Methyltransferase type 11  32.8 
 
 
304 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.301349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0300  hypothetical protein  37.5 
 
 
65 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.222502 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3665  hypothetical protein  43.48 
 
 
61 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1553  protein of unknown function DUF343  43.48 
 
 
60 aa  46.2  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331555  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0900  hypothetical protein  26.28 
 
 
313 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2306  hypothetical protein  43.48 
 
 
60 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190908  normal  0.12744 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2563  hypothetical protein  45.65 
 
 
60 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0238405  hitchhiker  0.00461164 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4893  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.48 
 
 
430 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0959  hypothetical protein  36.07 
 
 
67 aa  45.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0125  hypothetical protein  29.51 
 
 
339 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2181  hypothetical protein  39.13 
 
 
61 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25520  hypothetical protein  39.13 
 
 
61 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0837  hypothetical protein  37.5 
 
 
68 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00693289 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2731  hypothetical protein  35.42 
 
 
85 aa  44.3  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.923353  normal  0.0512047 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0891  hypothetical protein  44.19 
 
 
64 aa  44.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.883095  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3286  hypothetical protein  41.86 
 
 
64 aa  44.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0835  hypothetical protein  44.19 
 
 
64 aa  44.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.137665  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  42.31 
 
 
241 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1863  protein of unknown function DUF343  35.42 
 
 
69 aa  43.9  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1613  protein of unknown function DUF343  37.5 
 
 
66 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0487  hypothetical protein  37.5 
 
 
66 aa  43.9  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  hitchhiker  0.000621039 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2572  hypothetical protein  24.36 
 
 
313 aa  43.9  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.134075  normal  0.851171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  45.28 
 
 
261 aa  43.5  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1475  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 
294 aa  43.1  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2939  hypothetical protein  36.17 
 
 
63 aa  43.1  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43205  predicted protein  42.31 
 
 
181 aa  43.1  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000000000040449  normal  0.10617 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>