13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1316 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1316  CRISPR-associated protein, Cmr3  100 
 
 		 391 aa  775    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0648  CRISPR-associated Cmr3 family protein  38.92 
 
 		 358 aa  209  5e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.845582  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0262  hypothetical protein  35.44 
 
 		 360 aa  177  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2978  hypothetical protein  32.2 
 
 		 376 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1792  hypothetical protein  27.4 
 
 		 385 aa  97.1  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.900228  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1950  CRISPR-associated protein, Cmr3 family  25.66 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0628  CRISPR-associated Cmr3 family protein  29.07 
 
 		 383 aa  76.3  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1483  Cmr3 family CRISPR-associated protein  26.56 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.273926 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3379  hypothetical protein  25.5 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0317  putative DNA repair protein  24.75 
 
 		 375 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.641542  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0699  hypothetical protein  23.9 
 
 		 484 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1822  hypothetical protein  28.85 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0578  hypothetical protein  33.33 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.191176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>