17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1792 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1792  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  766    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.900228  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0262  hypothetical protein  34.79 
 
 		 360 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2978  hypothetical protein  33.78 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0648  CRISPR-associated Cmr3 family protein  32.38 
 
 		 358 aa  159  9e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.845582  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1950  CRISPR-associated protein, Cmr3 family  27.23 
 
 		 420 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0628  CRISPR-associated Cmr3 family protein  29.56 
 
 		 383 aa  100  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1316  CRISPR-associated protein, Cmr3  27.67 
 
 		 391 aa  96.7  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0317  putative DNA repair protein  23.87 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.641542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1195  CRISPR-associated protein, Cmr3  24.32 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15140  CRISPR-associated protein, Cmr3 family  23.12 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1483  Cmr3 family CRISPR-associated protein  26.6 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.273926 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3379  hypothetical protein  25.92 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1659  CRISPR-associated Cmr3 family protein  19.59 
 
 		 323 aa  50.1  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2691  hypothetical protein  25.89 
 
 		 388 aa  50.1  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.523861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0963  hypothetical protein  23.8 
 
 		 394 aa  49.7  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0699  hypothetical protein  25.31 
 
 		 484 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1027  CRISPR-associated Cmr3 family protein  24.12 
 
 		 330 aa  43.1  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>