21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1483 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1483  Cmr3 family CRISPR-associated protein  100 
 
 
376 aa  758    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.273926 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3379  hypothetical protein  66.22 
 
 
376 aa  496  1e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.572339  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0963  hypothetical protein  45.66 
 
 
394 aa  276  4e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0699  hypothetical protein  31.75 
 
 
484 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2691  hypothetical protein  30.75 
 
 
388 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.523861  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1822  hypothetical protein  33.75 
 
 
391 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2296  CRISPR-associated protein, Cmr3  30.68 
 
 
415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0578  hypothetical protein  29.58 
 
 
396 aa  106  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.191176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15140  CRISPR-associated protein, Cmr3 family  23.51 
 
 
393 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0317  putative DNA repair protein  24.81 
 
 
375 aa  87  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.641542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1195  CRISPR-associated protein, Cmr3  24.93 
 
 
376 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0628  CRISPR-associated Cmr3 family protein  32.09 
 
 
383 aa  80.1  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2978  hypothetical protein  24.33 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0262  hypothetical protein  27.67 
 
 
360 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1316  CRISPR-associated protein, Cmr3  26.56 
 
 
391 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0648  CRISPR-associated Cmr3 family protein  27.04 
 
 
358 aa  64.3  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.845582  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1950  CRISPR-associated protein, Cmr3 family  25.13 
 
 
420 aa  63.9  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1792  hypothetical protein  25.8 
 
 
385 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.900228  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1027  CRISPR-associated Cmr3 family protein  24.93 
 
 
330 aa  56.2  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1659  CRISPR-associated Cmr3 family protein  22.19 
 
 
323 aa  51.6  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1579  hypothetical protein  26.7 
 
 
382 aa  46.6  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>