16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0262 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0262  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  713    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0648  CRISPR-associated Cmr3 family protein  40.21 
 
 		 358 aa  225  8e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.845582  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2978  hypothetical protein  38.1 
 
 		 376 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1316  CRISPR-associated protein, Cmr3  37.12 
 
 		 391 aa  190  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1792  hypothetical protein  34.72 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.900228  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0628  CRISPR-associated Cmr3 family protein  32.78 
 
 		 383 aa  109  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1950  CRISPR-associated protein, Cmr3 family  27.08 
 
 		 420 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0317  putative DNA repair protein  26.74 
 
 		 375 aa  90.5  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.641542  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1483  Cmr3 family CRISPR-associated protein  27.95 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.273926 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1195  CRISPR-associated protein, Cmr3  26.7 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3379  hypothetical protein  27.25 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15140  CRISPR-associated protein, Cmr3 family  22.06 
 
 		 393 aa  55.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1027  CRISPR-associated Cmr3 family protein  23.8 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1659  CRISPR-associated Cmr3 family protein  21.45 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2691  hypothetical protein  23.94 
 
 		 388 aa  50.1  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.523861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0699  hypothetical protein  25.06 
 
 		 484 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>