21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1950 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_1950  CRISPR-associated protein, Cmr3 family  100 
 
 
420 aa  855    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1792  hypothetical protein  26.89 
 
 
385 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.900228  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2978  hypothetical protein  27.23 
 
 
376 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0262  hypothetical protein  26.6 
 
 
360 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15140  CRISPR-associated protein, Cmr3 family  24.77 
 
 
393 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0648  CRISPR-associated Cmr3 family protein  26.81 
 
 
358 aa  99.4  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.845582  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0628  CRISPR-associated Cmr3 family protein  28.23 
 
 
383 aa  96.7  8e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0317  putative DNA repair protein  25.06 
 
 
375 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.641542  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1316  CRISPR-associated protein, Cmr3  25.66 
 
 
391 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1195  CRISPR-associated protein, Cmr3  26.28 
 
 
376 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3379  hypothetical protein  24.18 
 
 
376 aa  72  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.572339  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1483  Cmr3 family CRISPR-associated protein  25.13 
 
 
376 aa  63.9  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.273926 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0699  hypothetical protein  23.91 
 
 
484 aa  63.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1659  CRISPR-associated Cmr3 family protein  21.67 
 
 
323 aa  59.7  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2296  CRISPR-associated protein, Cmr3  24.82 
 
 
415 aa  57  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1027  CRISPR-associated Cmr3 family protein  24.49 
 
 
330 aa  55.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2691  hypothetical protein  24.81 
 
 
388 aa  56.2  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.523861  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0963  hypothetical protein  25.58 
 
 
394 aa  53.5  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0659  hypothetical protein  23.76 
 
 
336 aa  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1822  hypothetical protein  21.91 
 
 
391 aa  47  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0578  hypothetical protein  23.46 
 
 
396 aa  46.6  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.191176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>