12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2905 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_2905  putative transposase  100 
 
 
48 aa  97.8  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3018  transposase IS4 family protein  89.36 
 
 
273 aa  87.8  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3537  transposase IS4 family protein  89.36 
 
 
273 aa  87.8  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3404  transposase IS4 family protein  87.23 
 
 
273 aa  87  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1186  transposase IS4 family protein  87.23 
 
 
273 aa  87  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0797  transposase IS4 family protein  87.23 
 
 
273 aa  87  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.756277  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3087  transposase IS4 family protein  87.23 
 
 
273 aa  86.7  9e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2780  transposase IS4 family protein  87.23 
 
 
273 aa  86.7  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2875  transposase IS4 family protein  74.47 
 
 
273 aa  75.5  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3323  transposase IS4 family protein  43.18 
 
 
287 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1220  transposase IS4 family protein  42.86 
 
 
284 aa  40  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.167513  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1573  transposase IS4 family protein  42.86 
 
 
284 aa  40  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.235002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>