52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0031 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0031  putative serine protein kinase, PrkA  100 
 
 
813 aa  1609    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168109  normal  0.0188605 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3368  putative serine protein kinase, PrkA  57.71 
 
 
761 aa  849    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0781677  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0411  putative serine protein kinase, PrkA  56.53 
 
 
774 aa  801    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.955964  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2232  putative serine protein kinase, PrkA  56.85 
 
 
760 aa  850    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.798823 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1749  putative serine protein kinase, PrkA  58.67 
 
 
762 aa  880    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2210  putative serine protein kinase, PrkA  24.5 
 
 
694 aa  135  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3529  putative serine protein kinase, PrkA  24.76 
 
 
692 aa  132  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.585407  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1379  putative serine protein kinase, PrkA  24.84 
 
 
692 aa  131  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0032  putative serine protein kinase, PrkA  24.09 
 
 
691 aa  125  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0177084 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2537  putative serine protein kinase, PrkA  22.86 
 
 
690 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.387634 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4175  putative serine protein kinase, PrkA  23.38 
 
 
692 aa  118  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.170003  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1230  putative serine protein kinase, PrkA  22.36 
 
 
690 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2989  PrkA AAA domain protein  23.09 
 
 
681 aa  116  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2635  putative serine protein kinase, PrkA  22.05 
 
 
690 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0964648  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2729  putative serine protein kinase, PrkA  22.05 
 
 
690 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1821  putative serine protein kinase, PrkA  22.31 
 
 
709 aa  114  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0916843  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2231  putative serine protein kinase, PrkA  21.73 
 
 
690 aa  112  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.795267  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4656  putative serine protein kinase, PrkA  22.69 
 
 
681 aa  109  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.234719  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1750  putative serine protein kinase, PrkA  21.35 
 
 
690 aa  105  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3367  putative serine protein kinase, PrkA  21.05 
 
 
690 aa  103  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337989  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0412  putative serine protein kinase, PrkA  21.83 
 
 
690 aa  84.7  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3006  putative serine protein kinase, PrkA  22.12 
 
 
633 aa  69.7  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1372  putative serine protein kinase, PrkA  21.96 
 
 
631 aa  64.7  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2404  putative serine protein kinase, PrkA  28.27 
 
 
753 aa  64.3  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0507  putative serine protein kinase, PrkA  21.96 
 
 
631 aa  63.9  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0168662  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2316  putative serine protein kinase, PrkA  28.4 
 
 
753 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1073  putative serine protein kinase, PrkA  21.91 
 
 
626 aa  61.2  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1550  putative serine protein kinase, PrkA  29.5 
 
 
753 aa  61.2  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.15082  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0510  putative serine protein kinase, PrkA  21.3 
 
 
630 aa  58.5  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0591  putative serine protein kinase, PrkA  21.76 
 
 
631 aa  58.5  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377685  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0472  putative serine protein kinase, PrkA  21.27 
 
 
631 aa  58.2  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2006  putative serine protein kinase, PrkA  20.56 
 
 
631 aa  57.8  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3334  putative serine protein kinase, PrkA  27.27 
 
 
765 aa  55.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.973297  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0518  hypothetical protein  21 
 
 
631 aa  55.1  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0550  hypothetical protein  21 
 
 
631 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.95802e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0605  hypothetical protein  21.14 
 
 
631 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0461  serine protein kinase  21 
 
 
631 aa  55.1  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0457  serine protein kinase  21 
 
 
631 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0550  hypothetical protein  21 
 
 
631 aa  55.1  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0240  putative serine protein kinase, PrkA  23.36 
 
 
762 aa  55.1  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.277133 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0625  hypothetical protein  21 
 
 
631 aa  54.7  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0465  putative serine protein kinase, PrkA  21.14 
 
 
631 aa  54.3  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0586  hypothetical protein  21 
 
 
631 aa  54.3  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4752  hypothetical protein  21 
 
 
631 aa  54.3  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000158136 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1156  putative serine protein kinase, PrkA  23.3 
 
 
631 aa  51.6  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0256  putative serine protein kinase, PrkA  22.37 
 
 
762 aa  50.8  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1541  serine protein kinase  19.25 
 
 
640 aa  47.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1205  putative serine protein kinase, PrkA  19.07 
 
 
642 aa  46.2  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1721  putative serine protein kinase, PrkA  19.81 
 
 
763 aa  46.6  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0489  putative serine protein kinase, PrkA  19.55 
 
 
644 aa  46.2  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1463  hypothetical protein  21.43 
 
 
644 aa  45.8  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1334  serine protein kinase  18.99 
 
 
640 aa  44.7  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.175734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>