140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1850 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1568  transposase, IS4 family protein  85.25 
 
 
457 aa  662    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2861  transposase, IS4 family protein  85.25 
 
 
457 aa  662    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0836  transposase, IS4 family protein  99.73 
 
 
460 aa  764    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1545  transposase, IS4 family protein  99.73 
 
 
460 aa  764    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1850  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
378 aa  776    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2804  transposase, IS4 family protein  99.73 
 
 
460 aa  764    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0130073  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0188  transposase, IS4 family protein  75.53 
 
 
462 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0692  transposase IS4 family protein  46.26 
 
 
450 aa  316  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0782  transposase IS4 family protein  46.26 
 
 
450 aa  316  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1951  transposase IS4 family protein  46.26 
 
 
450 aa  316  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2032  transposase IS4 family protein  46.26 
 
 
450 aa  316  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2134  transposase IS4 family protein  46.26 
 
 
450 aa  316  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2751  transposase IS4 family protein  46.26 
 
 
450 aa  316  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4159  transposase IS4 family protein  46.26 
 
 
450 aa  316  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4868  transposase IS4 family protein  46.26 
 
 
450 aa  316  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2274  transposase IS4 family protein  29.67 
 
 
455 aa  144  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2000  transposase IS4 family protein  29.67 
 
 
455 aa  144  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1159  transposase IS4 family protein  29.67 
 
 
455 aa  144  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00129993  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0939  transposase IS4 family protein  29.67 
 
 
455 aa  144  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1521  transposase IS4 family protein  29.67 
 
 
455 aa  144  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.626511  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0768  transposase IS4 family protein  29.67 
 
 
455 aa  144  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0758  transposase IS4 family protein  29.67 
 
 
455 aa  144  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.686568  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0684  transposase IS4 family protein  29.67 
 
 
455 aa  144  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2586  hypothetical protein  29.26 
 
 
411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.594312  normal  0.290376 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0016  hypothetical protein  29.12 
 
 
487 aa  119  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0231  hypothetical protein  29.12 
 
 
487 aa  119  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1384  hypothetical protein  29.12 
 
 
487 aa  119  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1527  hypothetical protein  29.12 
 
 
487 aa  119  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0837924  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1563  hypothetical protein  29.12 
 
 
487 aa  119  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.3587  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2373  hypothetical protein  29.12 
 
 
487 aa  119  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.653943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2594  hypothetical protein  29.12 
 
 
487 aa  119  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0041999  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2712  hypothetical protein  29.12 
 
 
487 aa  119  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0225597  normal  0.016579 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2724  hypothetical protein  29.12 
 
 
487 aa  119  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000151584 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3609  hypothetical protein  29.12 
 
 
487 aa  119  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.156017  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3610  hypothetical protein  29.12 
 
 
487 aa  119  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1536  hypothetical protein  48.06 
 
 
310 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1550  hypothetical protein  59.42 
 
 
136 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2639  hypothetical protein  29.48 
 
 
269 aa  82.4  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.486628  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3403  transposase, IS4 family protein  26.61 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.465217 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4408  transposase, IS4 family protein  26.61 
 
 
352 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0492743  normal  0.342026 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1136  transposase, IS4 family protein  26.61 
 
 
352 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3229  transposase, IS4  24.45 
 
 
405 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0079  transposase IS4 family protein  26.47 
 
 
395 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000349204  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0225  transposase IS4 family protein  26.47 
 
 
395 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.006695  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0252  transposase IS4 family protein  26.47 
 
 
395 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.566728  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0331  transposase IS4 family protein  26.47 
 
 
395 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000268151  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0408  transposase IS4 family protein  26.47 
 
 
395 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0432  transposase IS4 family protein  26.47 
 
 
395 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.931638  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0817  transposase IS4 family protein  26.47 
 
 
395 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.209477  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1498  transposase IS4 family protein  26.47 
 
 
395 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000398199  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2180  transposase IS4 family protein  26.47 
 
 
395 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000421211  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2707  transposase IS4 family protein  26.47 
 
 
395 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000168624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2690  transposase IS4 family protein  26.29 
 
 
391 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2824  transposase IS4 family protein  26.47 
 
 
395 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0317  transposase IS4 family protein  27.65 
 
 
395 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0328  transposase IS4 family protein  26.67 
 
 
395 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1163  transposase IS4 family protein  26.67 
 
 
395 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1394  transposase IS4 family protein  26.67 
 
 
395 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2152  transposase IS4 family protein  26.67 
 
 
395 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2937  transposase IS4 family protein  26.67 
 
 
395 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3596  transposase IS4 family protein  26.67 
 
 
395 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000661029  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0202  transposase IS4 family protein  26.11 
 
 
395 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1561  transposase IS4 family protein  26.11 
 
 
395 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1684  transposase IS4 family protein  26.11 
 
 
395 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2377  transposase IS4 family protein  26.11 
 
 
395 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0705  transposase IS4 family protein  27.06 
 
 
395 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1926  transposase IS4 family protein  29.87 
 
 
395 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2681  transposase IS4 family protein  29.17 
 
 
393 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000123658  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3859  transposase IS4 family protein  21.26 
 
 
358 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.631601 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0240  transposase, IS4  25.17 
 
 
328 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.192612  normal  0.536679 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1522  transposase, IS4  24.49 
 
 
328 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2138  transposase, IS4  24.49 
 
 
328 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.390955  normal  0.490082 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2313  transposase, IS4  24.49 
 
 
328 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3123  transposase, IS4  24.49 
 
 
328 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.147791  unclonable  0.0000172155 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2637  hypothetical protein  37.68 
 
 
227 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.63922  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1670  transposase IS4 family protein  25.48 
 
 
374 aa  46.6  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3280  transposase IS4 family protein  27.78 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3379  transposase IS4 family protein  27.78 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3566  transposase IS4 family protein  27.78 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0537  Transposase, ISC1217  26.75 
 
 
354 aa  45.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1359  Transposase, ISC1217  26.75 
 
 
354 aa  45.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2435  Transposase, ISC1217  26.75 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.27538  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2880  Transposase, ISC1217  26.75 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1854  hypothetical protein  27.34 
 
 
191 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00930083  normal  0.0408168 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0478  transposase, IS4  23.13 
 
 
328 aa  44.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.616853  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0375  Transposase, ISC1217  26.75 
 
 
354 aa  43.9  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0135211  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1960  Transposase, ISC1217  26.75 
 
 
354 aa  43.9  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2605  Transposase, ISC1217  26.75 
 
 
354 aa  43.9  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.458977  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2652  Transposase, ISC1217  26.75 
 
 
354 aa  43.9  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2794  Transposase, ISC1217  26.75 
 
 
354 aa  43.9  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2528  hypothetical protein  23.53 
 
 
195 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0686848  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1586  transposase IS4 family protein  22.3 
 
 
343 aa  44.3  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0169038 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4091  transposase IS4 family protein  38.24 
 
 
396 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4664  transposase IS4 family protein  38.24 
 
 
396 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2631  Transposase, ISC1217  26.75 
 
 
354 aa  43.5  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.728346  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2534  Transposase, ISC1217  26.75 
 
 
354 aa  43.5  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.664602  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1611  transposase, putative  29.27 
 
 
336 aa  43.5  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.77283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3953  transposase IS4 family protein  33.75 
 
 
412 aa  43.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.353815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4150  transposase IS4 family protein  33.75 
 
 
412 aa  43.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.277384 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6486  transposase IS4 family protein  33.75 
 
 
412 aa  43.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0808322  normal  0.416225 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>