143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3229 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3229  transposase, IS4  100 
 
 		 405 aa  842    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4091  transposase IS4 family protein  30.81 
 
 		 396 aa  206  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4664  transposase IS4 family protein  30.81 
 
 		 396 aa  206  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2681  transposase IS4 family protein  29.41 
 
 		 393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000123658  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0202  transposase IS4 family protein  28.14 
 
 		 395 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1561  transposase IS4 family protein  28.14 
 
 		 395 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1684  transposase IS4 family protein  28.14 
 
 		 395 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2377  transposase IS4 family protein  28.14 
 
 		 395 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1163  transposase IS4 family protein  28.14 
 
 		 395 aa  195  9e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0705  transposase IS4 family protein  28.86 
 
 		 395 aa  195  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2690  transposase IS4 family protein  29.11 
 
 		 391 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2824  transposase IS4 family protein  28.39 
 
 		 395 aa  192  9e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0079  transposase IS4 family protein  28.39 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000349204  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0225  transposase IS4 family protein  28.39 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.006695  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0252  transposase IS4 family protein  28.39 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.566728  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0331  transposase IS4 family protein  28.39 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000268151  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0408  transposase IS4 family protein  28.39 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0432  transposase IS4 family protein  28.39 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.931638  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0817  transposase IS4 family protein  28.39 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.209477  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1498  transposase IS4 family protein  28.39 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000398199  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2180  transposase IS4 family protein  28.39 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000421211  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2707  transposase IS4 family protein  28.39 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000168624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0328  transposase IS4 family protein  27.89 
 
 		 395 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1394  transposase IS4 family protein  27.89 
 
 		 395 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2152  transposase IS4 family protein  27.89 
 
 		 395 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2937  transposase IS4 family protein  27.89 
 
 		 395 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3596  transposase IS4 family protein  27.89 
 
 		 395 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000661029  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1926  transposase IS4 family protein  29.35 
 
 		 395 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3566  transposase IS4 family protein  29.82 
 
 		 395 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0317  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 		 395 aa  189  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3280  transposase IS4 family protein  29.57 
 
 		 395 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3379  transposase IS4 family protein  29.57 
 
 		 395 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1670  transposase IS4 family protein  25.38 
 
 		 374 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1744  transposase IS4 family protein  26.16 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2586  hypothetical protein  24.91 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.594312  normal  0.290376 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2594  hypothetical protein  24.91 
 
 		 487 aa  61.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0041999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0836  transposase, IS4 family protein  24.66 
 
 		 460 aa  60.1  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1545  transposase, IS4 family protein  24.66 
 
 		 460 aa  60.1  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2804  transposase, IS4 family protein  24.66 
 
 		 460 aa  60.1  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0130073  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0016  hypothetical protein  24.63 
 
 		 487 aa  59.7  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0231  hypothetical protein  24.63 
 
 		 487 aa  59.7  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1384  hypothetical protein  24.63 
 
 		 487 aa  59.7  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1527  hypothetical protein  24.63 
 
 		 487 aa  59.7  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0837924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1563  hypothetical protein  24.63 
 
 		 487 aa  59.7  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.3587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2373  hypothetical protein  24.63 
 
 		 487 aa  59.7  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.653943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2724  hypothetical protein  24.63 
 
 		 487 aa  59.7  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000151584 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3609  hypothetical protein  24.63 
 
 		 487 aa  59.7  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.156017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3610  hypothetical protein  24.63 
 
 		 487 aa  59.7  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2712  hypothetical protein  24.91 
 
 		 487 aa  59.7  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0225597  normal  0.016579 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1568  transposase, IS4 family protein  23.4 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2861  transposase, IS4 family protein  23.4 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3250  hypothetical protein  21.29 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0692  transposase IS4 family protein  22.96 
 
 		 450 aa  56.2  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0782  transposase IS4 family protein  22.96 
 
 		 450 aa  56.2  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1951  transposase IS4 family protein  22.96 
 
 		 450 aa  56.2  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2032  transposase IS4 family protein  22.96 
 
 		 450 aa  56.2  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2134  transposase IS4 family protein  22.96 
 
 		 450 aa  56.2  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2751  transposase IS4 family protein  22.96 
 
 		 450 aa  56.2  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4159  transposase IS4 family protein  22.96 
 
 		 450 aa  56.2  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4868  transposase IS4 family protein  22.96 
 
 		 450 aa  56.2  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1850  transposase, IS4 family protein  24.45 
 
 		 378 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0188  transposase, IS4 family protein  25.35 
 
 		 462 aa  53.9  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3403  transposase, IS4 family protein  22.88 
 
 		 352 aa  53.9  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.465217 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1388  transposase IS4 family protein  21.71 
 
 		 343 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0249332 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4408  transposase, IS4 family protein  20.33 
 
 		 352 aa  50.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0492743  normal  0.342026 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1136  transposase, IS4 family protein  20.33 
 
 		 352 aa  50.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1159  transposase IS4 family protein  23.88 
 
 		 455 aa  48.5  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00129993  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2274  transposase IS4 family protein  23.88 
 
 		 455 aa  48.5  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2000  transposase IS4 family protein  23.88 
 
 		 455 aa  48.5  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1521  transposase IS4 family protein  23.88 
 
 		 455 aa  48.5  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.626511  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1586  transposase IS4 family protein  21.32 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0169038 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0939  transposase IS4 family protein  23.88 
 
 		 455 aa  48.5  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0768  transposase IS4 family protein  23.88 
 
 		 455 aa  48.5  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0758  transposase IS4 family protein  23.88 
 
 		 455 aa  48.5  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.686568  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0684  transposase IS4 family protein  23.88 
 
 		 455 aa  48.5  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1179  hypothetical protein  33.33 
 
 		 458 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3881  hypothetical protein  33.33 
 
 		 458 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3235  hypothetical protein  21.32 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0294411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2708  transposase IS4 family protein  21.32 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52704  normal  0.80509 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2667  transposase IS4 family protein  21.32 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.423553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2915  transposase IS4 family protein  21.32 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000386305  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1496  transposase IS4 family protein  21.32 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.279239  hitchhiker  0.000413072 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0007  transposase IS4 family protein  21.32 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000467317  normal  0.127483 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0960  transposase IS4 family protein  21.32 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0838  transposase IS4 family protein  21.32 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2160  transposase IS4 family protein  21.32 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.639372  normal  0.128102 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1934  transposase IS4 family protein  21.32 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1347  transposase IS4 family protein  21.32 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.18568  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0124  transposase IS4 family protein  21.32 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.440826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0020  transposase IS4 family protein  21.32 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.390946 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0797  transposase IS4 family protein  21.32 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1174  transposase IS4 family protein  21.32 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.232233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0906  transposase IS4 family protein  21.32 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.444725  normal  0.0364065 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0398  transposase IS4 family protein  21.32 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.700865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1498  transposase IS4 family protein  21.32 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.29415  hitchhiker  0.000395653 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1465  transposase IS4 family protein  21.32 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464265 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1227  transposase IS4 family protein  21.32 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00131975  normal  0.741688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2087  transposase IS4 family protein  21.32 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2651  transposase IS4 family protein  21.32 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2363  transposase IS4 family protein  21.32 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000393238  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>