69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1550 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1550  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  285  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1951  transposase IS4 family protein  58.62 
 
 
450 aa  159  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0782  transposase IS4 family protein  58.62 
 
 
450 aa  159  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0692  transposase IS4 family protein  58.62 
 
 
450 aa  159  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2032  transposase IS4 family protein  58.62 
 
 
450 aa  159  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4868  transposase IS4 family protein  58.62 
 
 
450 aa  159  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4159  transposase IS4 family protein  58.62 
 
 
450 aa  159  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2751  transposase IS4 family protein  58.62 
 
 
450 aa  159  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2134  transposase IS4 family protein  58.62 
 
 
450 aa  159  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2804  transposase, IS4 family protein  52.14 
 
 
460 aa  135  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0130073  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1545  transposase, IS4 family protein  52.14 
 
 
460 aa  135  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0836  transposase, IS4 family protein  52.14 
 
 
460 aa  135  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0188  transposase, IS4 family protein  54.29 
 
 
462 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1568  transposase, IS4 family protein  53.33 
 
 
457 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2861  transposase, IS4 family protein  53.33 
 
 
457 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1850  transposase, IS4 family protein  59.42 
 
 
378 aa  91.3  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0684  transposase IS4 family protein  29.2 
 
 
455 aa  58.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0758  transposase IS4 family protein  29.2 
 
 
455 aa  58.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.686568  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0768  transposase IS4 family protein  29.2 
 
 
455 aa  58.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0939  transposase IS4 family protein  29.2 
 
 
455 aa  58.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1159  transposase IS4 family protein  29.2 
 
 
455 aa  58.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00129993  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1521  transposase IS4 family protein  29.2 
 
 
455 aa  58.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.626511  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2000  transposase IS4 family protein  29.2 
 
 
455 aa  58.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2274  transposase IS4 family protein  29.2 
 
 
455 aa  58.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0231  hypothetical protein  31.25 
 
 
487 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0016  hypothetical protein  31.25 
 
 
487 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1563  hypothetical protein  31.25 
 
 
487 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.3587  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2373  hypothetical protein  31.25 
 
 
487 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.653943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2594  hypothetical protein  31.25 
 
 
487 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0041999  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2712  hypothetical protein  31.65 
 
 
487 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0225597  normal  0.016579 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2724  hypothetical protein  31.25 
 
 
487 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000151584 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1527  hypothetical protein  31.25 
 
 
487 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0837924  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3609  hypothetical protein  31.25 
 
 
487 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.156017  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1384  hypothetical protein  31.25 
 
 
487 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3610  hypothetical protein  31.25 
 
 
487 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2637  hypothetical protein  31.65 
 
 
227 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.63922  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2377  transposase IS4 family protein  34.78 
 
 
395 aa  42.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1684  transposase IS4 family protein  34.78 
 
 
395 aa  42.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1561  transposase IS4 family protein  34.78 
 
 
395 aa  42.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1847  hypothetical protein  43.24 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2681  transposase IS4 family protein  55.56 
 
 
393 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000123658  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0202  transposase IS4 family protein  34.78 
 
 
395 aa  42.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2690  transposase IS4 family protein  34.33 
 
 
391 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2824  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
395 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2707  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
395 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000168624  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0079  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
395 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000349204  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0225  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
395 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.006695  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0252  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
395 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.566728  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0331  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
395 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000268151  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0408  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
395 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0432  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
395 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.931638  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0817  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
395 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.209477  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1498  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
395 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000398199  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2180  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
395 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000421211  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2152  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
395 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1394  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
395 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1163  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
395 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2937  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
395 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0328  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
395 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3596  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
395 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000661029  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0705  transposase IS4 family protein  50 
 
 
395 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3566  transposase IS4 family protein  48.65 
 
 
395 aa  40.4  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3379  transposase IS4 family protein  48.65 
 
 
395 aa  40.4  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3280  transposase IS4 family protein  48.65 
 
 
395 aa  40.4  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0317  transposase IS4 family protein  50 
 
 
395 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1926  transposase IS4 family protein  50 
 
 
395 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4657  transposase IS4 family protein  32.14 
 
 
414 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3996  transposase IS4 family protein  32.14 
 
 
414 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0015  transposase, IS4 family protein  32.05 
 
 
252 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>