25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_R0003 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_R0003  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.110757 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0011  tRNA-Thr  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00527391  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0003  tRNA-Thr  97.3 
 
 		 75 bp  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0015  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.728322 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0035  tRNA-Thr  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.367362 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0028  tRNA-Thr  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA25  tRNA-Thr  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0020  tRNA-Thr  97.92 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0058  tRNA-Thr  97.92 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0054  tRNA-Thr  97.92 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0048  tRNA-Thr  97.92 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.219077 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0042    95.83 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00632518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0043  tRNA-Thr  95.83 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0057  tRNA-Thr  95.83 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0026  tRNA-Thr  95.83 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.219197  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0040  tRNA-Thr  95.83 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0042  tRNA-Thr  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158394  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0015  tRNA-Thr  86.89 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.870912 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAThrVIMSS1309283  tRNA-Thr  85.25 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0028  tRNA-Thr  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4304  tRNA-Thr  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.300189  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0039  tRNA-Met  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.788311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0035  tRNA-Met  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0089  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.62711e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0061  tRNA-Arg  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000000631723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>