More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2954 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2954  inositol monophosphatase  100 
 
 
286 aa  562  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0354576  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2040  inositol monophosphatase  55.56 
 
 
287 aa  263  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.258662  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2809  inositol-phosphate phosphatase  49.43 
 
 
272 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11620  inositol-monophosphatase impA  52.38 
 
 
270 aa  250  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.181318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3608  inositol-phosphate phosphatase  51.72 
 
 
272 aa  249  5e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.809381  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3074  inositol-phosphate phosphatase  48.34 
 
 
271 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.447114 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3058  inositol monophosphatase  48.34 
 
 
271 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.726041  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3117  inositol monophosphatase  48.34 
 
 
271 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0892  inositol monophosphatase  37.83 
 
 
272 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3024  Inositol-phosphate phosphatase  36.6 
 
 
261 aa  132  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.471831  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30310  inositol monophosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase family protein  36.79 
 
 
265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1212  fructose-1 6-bisphosphatase  33.72 
 
 
273 aa  125  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.286322  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1712  hypothetical protein  31.03 
 
 
261 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1712  hypothetical protein  31.03 
 
 
261 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1241  inositol monophosphatase  32.37 
 
 
267 aa  106  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.921359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2754  inositol monophosphatase  35.1 
 
 
267 aa  105  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00416326  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1101  inositol monophosphatase  34.29 
 
 
267 aa  105  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2074  Inositol-phosphate phosphatase  35.84 
 
 
270 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0901  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase-like  31.08 
 
 
282 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.295262  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0669  inositol monophosphate family protein  30.22 
 
 
267 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0818  Inositol-phosphate phosphatase  30.22 
 
 
267 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0219186  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1798  inositol-phosphate phosphatase  27.17 
 
 
258 aa  102  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.186546  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0898  Inositol-phosphate phosphatase  27.86 
 
 
265 aa  102  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000281614  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2609  inositol monophosphatase family protein  33.33 
 
 
270 aa  102  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09601  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  31.08 
 
 
282 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.845996  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09621  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  31.08 
 
 
282 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1036  Inositol-phosphate phosphatase  29.7 
 
 
269 aa  100  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0561  Inositol-phosphate phosphatase  30.36 
 
 
268 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3034  inositol monophosphatase  31.95 
 
 
267 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.251178  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0543  inositol-phosphate phosphatase  30.97 
 
 
263 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3316  inositol monophosphatase  32.35 
 
 
262 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4997  Inositol-phosphate phosphatase  32.05 
 
 
264 aa  99.8  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000132366  normal  0.733856 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1321  inositol-phosphate phosphatase  30.17 
 
 
262 aa  99.4  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218475  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00388  inositol-1-monophosphatase  30.29 
 
 
277 aa  99.4  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25186  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1789  inositol-1(or 4)-monophosphatase  28.46 
 
 
264 aa  98.6  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.383768  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0054  inositol monophosphatase  32.76 
 
 
255 aa  99  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.56898  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3630  inositol monophosphatase  33.2 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0471893  normal  0.858784 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0813  inositol monophosphatase  28.69 
 
 
268 aa  97.8  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000261138  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0687  Inositol-phosphate phosphatase  33.19 
 
 
292 aa  97.4  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2747  Inositol-phosphate phosphatase  30.13 
 
 
275 aa  97.4  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1273  inositol monophosphatase  31.98 
 
 
267 aa  96.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000425107  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0438  inositol monophosphatase  31.98 
 
 
267 aa  96.7  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450003  hitchhiker  0.0000301386 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1165  inositol monophosphatase  31.98 
 
 
267 aa  96.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000142854  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2598  inositol monophosphatase  24.6 
 
 
309 aa  96.3  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.624255  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  32.59 
 
 
283 aa  95.9  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2186  inositol monophosphatase  30.74 
 
 
259 aa  95.9  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1378  inositol monophosphatase  28.51 
 
 
256 aa  95.9  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000032162  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2439  inositol-1-monophosphatase  29.52 
 
 
315 aa  95.5  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2746  inositol monophosphatase  31.56 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139672  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3566  inositol monophosphatase  30.64 
 
 
353 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1308  inositol monophosphatase  28.51 
 
 
256 aa  94.7  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.730975  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1280  inositol-1-monophosphatase  28.45 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0078  inositol-phosphate phosphatase  30.13 
 
 
270 aa  94  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2787  inositol monophosphatase  31.56 
 
 
267 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0013173  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2908  inositol monophosphatase  31.56 
 
 
267 aa  93.6  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000930444  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1244  inositol-phosphate phosphatase  32.17 
 
 
266 aa  94  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09811  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  30.88 
 
 
282 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.641106  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2808  inositol monophosphatase  31.56 
 
 
267 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0630411  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2921  inositol monophosphatase  31.56 
 
 
267 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0208321  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2701  inositol monophosphatase  31.56 
 
 
267 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1218  inositol-phosphate phosphatase  30.17 
 
 
431 aa  93.2  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2282  inositol monophosphatase  31.03 
 
 
266 aa  93.2  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.476526  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1231  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  28.94 
 
 
263 aa  93.2  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0360912  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0161  extragenic suppressor protein SuhB  30.17 
 
 
267 aa  92.8  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.17708  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1076  inositol monophosphatase  30.47 
 
 
263 aa  92.4  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0543949  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3537  inositol-1(or 4)-monophosphatase  31.44 
 
 
263 aa  92.4  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2273  inositol monophosphatase  27.9 
 
 
266 aa  92.4  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0668825  normal  0.139934 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02425  inositol monophosphatase  31.15 
 
 
267 aa  92  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1135  Inositol-phosphate phosphatase  31.15 
 
 
267 aa  92  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915199  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3765  inositol monophosphatase  31.15 
 
 
267 aa  92  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0228752  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2818  inositol monophosphatase  31.15 
 
 
267 aa  92  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000612182  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1401  inositol-1(or 4)-monophosphatase  29.7 
 
 
295 aa  92  9e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.429146  normal  0.812945 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1144  inositol monophosphatase  31.15 
 
 
267 aa  92  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221581  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02389  hypothetical protein  31.15 
 
 
267 aa  92  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2686  inositol monophosphatase  31.15 
 
 
267 aa  92  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.10987  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2685  inositol monophosphatase  31.15 
 
 
267 aa  92  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000252767  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1128  inositol-1-monophosphatase  30.29 
 
 
267 aa  91.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.768163  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2706  inositol monophosphatase  28.7 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000310915 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3672  extragenic suppressor protein SuhB  27.59 
 
 
266 aa  92  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0672  inositol-1(or 4)-monophosphatase  30.77 
 
 
273 aa  92  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000135062  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  31.84 
 
 
267 aa  91.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_004310  BR1711  inositol monophosphatase family protein  29.61 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  32.19 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000252035  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  31.6 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0500  Inositol-phosphate phosphatase  28.96 
 
 
261 aa  91.3  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  32.19 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  32.19 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  32.19 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1028  inositol monophosphatase  28.7 
 
 
269 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00157763  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1510  inositol monophosphatase  27.17 
 
 
266 aa  90.5  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1410  inositol-1(or 4)-monophosphatase  27.97 
 
 
267 aa  89.7  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1501  inositol monophosphatase  34.02 
 
 
278 aa  90.1  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.421731 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01351  inositol-1-monophosphatase  34.36 
 
 
255 aa  90.1  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104947  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1454  inositol monophosphatase  31.09 
 
 
267 aa  89  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00259546  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1815  inositol-phosphate phosphatase  31.47 
 
 
267 aa  89.4  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1653  inositol monophosphatase family protein  29.18 
 
 
263 aa  89  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2260  extragenic suppressor protein SuhB  31.47 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0018  inositol monophosphatase  28.05 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000389361  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3216  inositol-phosphate phosphatase  29.13 
 
 
263 aa  88.6  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2841  inositol-1(or 4)-monophosphatase  28.96 
 
 
330 aa  88.2  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202978  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>