20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0217 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0217  EAL domain protein  100 
 
 		 402 aa  799    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4323  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.73 
 
 		 743 aa  169  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366607  normal  0.0420324 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4732  diguanylate phosphodiesterase  33.75 
 
 		 408 aa  149  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1320  diguanylate phosphodiesterase  27.39 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.463856 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1667  diguanylate phosphodiesterase  29.79 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3143  diguanylate phosphodiesterase  27.89 
 
 		 425 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186111  normal  0.375725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4228  putative sensor protein  34.27 
 
 		 282 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3576  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 705 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1006  diguanylate phosphodiesterase  28.61 
 
 		 601 aa  53.1  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155434  decreased coverage  0.00194225 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3573  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 		 650 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.287908 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3003  diguanylate phosphodiesterase  32.08 
 
 		 387 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176635 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1645  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 358 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1388  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.74 
 
 		 806 aa  46.6  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.844108  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1951  putative sensor protein  25.81 
 
 		 460 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1978  putative sensor protein  25.81 
 
 		 460 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0948256 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4298  putative sensor protein  27.42 
 
 		 463 aa  46.2  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.204106 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.65 
 
 		 691 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.582434  normal  0.199494 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0482  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.65 
 
 		 691 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0533  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.77 
 
 		 970 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.935916 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0555  putative sensor protein  25.83 
 
 		 468 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>