12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0208 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0208  hypothetical protein  100 
 
 
764 aa  1536    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1163  hypothetical protein  52.17 
 
 
636 aa  343  5e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.416407  normal  0.739932 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5397  hypothetical protein  54.01 
 
 
676 aa  336  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71515  normal  0.180581 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5016  hypothetical protein  53.74 
 
 
676 aa  335  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.978148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5104  hypothetical protein  53.74 
 
 
676 aa  335  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0165  arabinosyltransferase AftB  53.43 
 
 
667 aa  331  3e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.20892  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5646  hypothetical protein  49.64 
 
 
668 aa  325  3e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13839  transmembrane protein  51.23 
 
 
627 aa  323  9.000000000000001e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.240396  normal  0.0556328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1208  hypothetical protein  37 
 
 
641 aa  150  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2505  hypothetical protein  27.38 
 
 
768 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0215  Beta-ketoacyl synthase  35.04 
 
 
1759 aa  45.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2725  hypothetical protein  25.86 
 
 
698 aa  44.7  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>