14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0165 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0165  arabinosyltransferase AftB  100 
 
 
667 aa  1330    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.20892  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1163  hypothetical protein  50.68 
 
 
636 aa  597  1e-169  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.416407  normal  0.739932 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5016  hypothetical protein  51.38 
 
 
676 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.978148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5104  hypothetical protein  51.38 
 
 
676 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5397  hypothetical protein  51.38 
 
 
676 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71515  normal  0.180581 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5646  hypothetical protein  49.42 
 
 
668 aa  566  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13839  transmembrane protein  49.53 
 
 
627 aa  546  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.240396  normal  0.0556328 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0208  hypothetical protein  53.68 
 
 
764 aa  337  5e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2725  hypothetical protein  30.35 
 
 
698 aa  65.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1208  hypothetical protein  28.65 
 
 
641 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2508  hypothetical protein  26.55 
 
 
649 aa  54.7  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0564678  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4276  hypothetical protein  25.3 
 
 
735 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00531849  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2505  hypothetical protein  26.62 
 
 
768 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1411  hypothetical protein  23.89 
 
 
303 aa  44.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00357704  normal  0.0994638 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>