12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1208 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1208  hypothetical protein  100 
 
 
641 aa  1277    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1163  hypothetical protein  34.8 
 
 
636 aa  270  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.416407  normal  0.739932 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5016  hypothetical protein  35.44 
 
 
676 aa  257  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.978148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5104  hypothetical protein  35.44 
 
 
676 aa  257  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5397  hypothetical protein  35.27 
 
 
676 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71515  normal  0.180581 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13839  transmembrane protein  34.13 
 
 
627 aa  246  8e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.240396  normal  0.0556328 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5646  hypothetical protein  35.37 
 
 
668 aa  239  8e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0165  arabinosyltransferase AftB  29.61 
 
 
667 aa  197  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.20892  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0208  hypothetical protein  36.75 
 
 
764 aa  184  6e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2725  hypothetical protein  28.52 
 
 
698 aa  61.2  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2505  hypothetical protein  28.74 
 
 
768 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01280  hypothetical protein  27.42 
 
 
576 aa  46.6  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.292249  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>