29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2618 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2618  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  335  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1611  hypothetical protein  96.25 
 
 		 160 aa  322  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1805  hypothetical protein  71.88 
 
 		 160 aa  243  6.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.590872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0640  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.3 
 
 		 902 aa  89  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112639 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3439  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  51.85 
 
 		 796 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.35 
 
 		 776 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.98211  hitchhiker  0.000275945 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3145  FAD dependent oxidoreductase  52.56 
 
 		 769 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1000  hypothetical protein  55.17 
 
 		 67 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0221  Fe-S oxidoreductase  43.37 
 
 		 771 aa  73.6  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3541  hypothetical protein  51.67 
 
 		 71 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1550  hypothetical protein  41.25 
 
 		 788 aa  68.9  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0999  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.96 
 
 		 771 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0222  hypothetical protein  50.85 
 
 		 68 aa  68.2  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1809  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  41.18 
 
 		 768 aa  65.9  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.175846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1576  hypothetical protein  50 
 
 		 71 aa  65.1  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0733897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3438  hypothetical protein  46.77 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1560  hypothetical protein  45.76 
 
 		 69 aa  63.9  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00968564  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1549  hypothetical protein  47.46 
 
 		 68 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3272  hypothetical protein  43.33 
 
 		 74 aa  63.2  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1821  hypothetical protein  47.54 
 
 		 71 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3271  Fe-S oxidoreductase  32 
 
 		 763 aa  62.4  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1473  hypothetical protein  39.66 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1561  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.59 
 
 		 758 aa  57.8  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.139736  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3144  hypothetical protein  39.66 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1810  hypothetical protein  38.57 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.842677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1474  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.36 
 
 		 784 aa  52.4  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.293744  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1575  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 797 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0497596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3540  aldehyde dehydrogenase, iron-sulfur subunit  39.47 
 
 		 836 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1822  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.97 
 
 		 802 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>