29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1805 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1805  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  335  9.999999999999999e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.590872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1611  hypothetical protein  73.12 
 
 		 160 aa  248  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2618  hypothetical protein  71.88 
 
 		 160 aa  243  6.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3439  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  48.78 
 
 		 796 aa  87  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50 
 
 		 776 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.98211  hitchhiker  0.000275945 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0640  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.02 
 
 		 902 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112639 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3145  FAD dependent oxidoreductase  51.28 
 
 		 769 aa  79  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1000  hypothetical protein  58.62 
 
 		 67 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3541  hypothetical protein  51.67 
 
 		 71 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1550  hypothetical protein  41.46 
 
 		 788 aa  72.4  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0221  Fe-S oxidoreductase  38.55 
 
 		 771 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0999  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.8 
 
 		 771 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3271  Fe-S oxidoreductase  35.62 
 
 		 763 aa  65.5  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1821  hypothetical protein  45.16 
 
 		 71 aa  64.3  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1549  hypothetical protein  47.46 
 
 		 68 aa  63.9  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0222  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1474  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.74 
 
 		 784 aa  61.2  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.293744  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1576  hypothetical protein  48.48 
 
 		 71 aa  60.8  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0733897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1809  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  38.82 
 
 		 768 aa  60.5  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.175846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3272  hypothetical protein  40 
 
 		 74 aa  58.9  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3438  hypothetical protein  43.55 
 
 		 70 aa  58.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1560  hypothetical protein  46.55 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00968564  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1810  hypothetical protein  45.76 
 
 		 71 aa  57  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.842677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1473  hypothetical protein  36.21 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1822  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.19 
 
 		 802 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1561  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.5 
 
 		 758 aa  53.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.139736  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1575  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.78 
 
 		 797 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0497596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3144  hypothetical protein  37.93 
 
 		 69 aa  51.2  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3540  aldehyde dehydrogenase, iron-sulfur subunit  40.28 
 
 		 836 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>