More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1718 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1718  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 252 aa  523  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.57021  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1849  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 252 aa  523  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2505  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  99.21 
 
 		 252 aa  520  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2561  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  84.52 
 
 		 252 aa  435  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000775273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1515  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  84.52 
 
 		 252 aa  435  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0436137  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2704  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  82.54 
 
 		 252 aa  431  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0477  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.74 
 
 		 252 aa  349  3e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2743  phosphate ABC transporter permease  64.86 
 
 		 259 aa  342  2.9999999999999997e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00299446  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0483  phosphate ABC transporter ATPase subunit  64.26 
 
 		 277 aa  338  4e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0590  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.18 
 
 		 258 aa  338  5e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1569  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.1 
 
 		 251 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1416  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.49 
 
 		 251 aa  335  3.9999999999999995e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00175163  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0350  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  62.7 
 
 		 251 aa  334  7.999999999999999e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000161831 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4145  phosphate transporter ATP-binding protein  63.45 
 
 		 262 aa  334  7.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2650  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  64.11 
 
 		 285 aa  334  9e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.567129  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2936  phosphate ABC transporter ATPase subunit  61.63 
 
 		 258 aa  333  1e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0486  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  62.7 
 
 		 251 aa  334  1e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4003  phosphate transporter ATP-binding protein  63.45 
 
 		 262 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0114  phosphate ABC transporter permease  63.45 
 
 		 252 aa  332  3e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8334  phosphate ABC transporter permease  60.47 
 
 		 258 aa  332  4e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3638  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.28 
 
 		 267 aa  332  4e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000916154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4119  phosphate transporter ATP-binding protein  63.05 
 
 		 262 aa  331  6e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0821  phosphate ABC transporter permease  63.89 
 
 		 286 aa  331  6e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2521  phosphate ABC transporter ATPase subunit  60.71 
 
 		 273 aa  331  6e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0748442  normal  0.186434 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0572  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.11 
 
 		 251 aa  331  7.000000000000001e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4381  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.55 
 
 		 259 aa  331  8e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0469  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.2 
 
 		 254 aa  330  1e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4579  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.56 
 
 		 272 aa  330  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.723553  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0182  phosphate transporter ATP-binding protein  63.71 
 
 		 277 aa  330  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0509  phosphate transporter ATP-binding protein  62.25 
 
 		 273 aa  330  2e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  62.5 
 
 		 261 aa  329  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2983  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.69 
 
 		 253 aa  329  2e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1410  phosphate transporter ATP-binding protein  62.1 
 
 		 272 aa  330  2e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.261593  normal  0.0224304 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2972  ABC phosphate transporter, ATPase subunit  61.66 
 
 		 253 aa  329  3e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0954  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.27 
 
 		 276 aa  328  6e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222469  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4414  phosphate transporter ATP-binding protein  62.9 
 
 		 276 aa  328  6e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2831  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.2 
 
 		 252 aa  328  7e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0421  phosphate transporter ATP-binding protein  63.05 
 
 		 260 aa  327  8e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2396  ABC phosphate transporter, ATPase subunit  62.25 
 
 		 283 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.874884  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0586  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.6 
 
 		 272 aa  327  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.518906 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1137  phosphate transporter ATP-binding protein  63.71 
 
 		 285 aa  327  1.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0093  phosphate transporter ATP-binding protein  62.99 
 
 		 284 aa  327  1.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1156  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.45 
 
 		 255 aa  326  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1483  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.29 
 
 		 249 aa  326  2.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48570  phosphate transporter ATP-binding protein  64.61 
 
 		 277 aa  326  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1439  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  61.45 
 
 		 255 aa  326  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4000  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.7 
 
 		 265 aa  325  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1359  phosphate transporter ATP-binding protein  60.56 
 
 		 272 aa  325  3e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0675287  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0355  phosphate transporter ATP-binding protein  59.69 
 
 		 258 aa  325  3e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.584479  normal  0.0138641 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0229  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.71 
 
 		 251 aa  325  4.0000000000000003e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21550  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.65 
 
 		 253 aa  325  4.0000000000000003e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1992  phosphate transporter ATP-binding protein  61.45 
 
 		 249 aa  325  4.0000000000000003e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5263  phosphate transporter ATP-binding protein  61.45 
 
 		 273 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37650  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61 
 
 		 259 aa  325  4.0000000000000003e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0806666 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_149  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  61.51 
 
 		 251 aa  325  5e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3166  phosphate transporter ATP-binding protein  61.29 
 
 		 272 aa  325  5e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4920  phosphate transporter ATP-binding protein  61.85 
 
 		 275 aa  325  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.506329 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4978  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.78 
 
 		 259 aa  325  6e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0423  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  59.92 
 
 		 251 aa  325  6e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1910  phosphate transporter ATP-binding protein  63.05 
 
 		 256 aa  325  6e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1013  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.3 
 
 		 251 aa  324  7e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2104  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.45 
 
 		 252 aa  324  9e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0653  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.84 
 
 		 282 aa  323  1e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.316011 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1781  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.24 
 
 		 258 aa  324  1e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0836  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.51 
 
 		 260 aa  323  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00992429 
 
 
-
 
NC_002936  DET0141  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.32 
 
 		 251 aa  323  2e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0498  phosphate ABC transporter permease  59.76 
 
 		 254 aa  323  2e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2386  phosphate transporter ATP-binding protein  63.05 
 
 		 253 aa  323  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00455032  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1503  phosphate transporter ATP-binding protein  60.89 
 
 		 272 aa  323  2e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.529486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8263  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.47 
 
 		 258 aa  323  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0622  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.64 
 
 		 269 aa  323  2e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.970932  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2582  phosphate transporter ATP-binding protein  60.16 
 
 		 272 aa  322  3e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70810  phosphate transporter ATP-binding protein  62.25 
 
 		 277 aa  322  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.356471 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3160  phosphate transporter ATP-binding protein  60.89 
 
 		 258 aa  322  3e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6145  phosphate transporter ATP-binding protein  62.25 
 
 		 277 aa  322  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0891  phosphate transporter ATP-binding protein  61.04 
 
 		 274 aa  322  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2267  phosphate transporter ATP-binding protein  62.25 
 
 		 303 aa  322  5e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0539  phosphate ABC transporter permease  62.81 
 
 		 272 aa  321  5e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0749  ABC phosphate transporter, ATPase subunit  61.51 
 
 		 255 aa  322  5e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000330265  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1700  phosphate transporter ATP-binding protein  60.89 
 
 		 272 aa  322  5e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0365  phosphate transporter ATP-binding protein  58.69 
 
 		 259 aa  321  6e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0872  phosphate transporter ATP-binding protein  59.3 
 
 		 258 aa  321  6e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.142504 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1595  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.54 
 
 		 301 aa  321  6e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1079  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.85 
 
 		 252 aa  321  7e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.376922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1535  phosphate transporter ATP-binding protein  60.08 
 
 		 272 aa  321  8e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.172939  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0638  phosphate transporter ATP-binding protein  61.45 
 
 		 272 aa  321  8e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5373  phosphate transporter ATP-binding protein  62.5 
 
 		 277 aa  321  8e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2816  phosphate transporter ATP-binding protein  60.08 
 
 		 272 aa  321  8e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0379  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.36 
 
 		 254 aa  321  8e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.198087  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1568  phosphate transporter ATP-binding protein  60.08 
 
 		 272 aa  321  8e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.120557  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1540  phosphate transporter ATP-binding protein  60.08 
 
 		 272 aa  321  8e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31840  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  57.92 
 
 		 259 aa  321  9.000000000000001e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2558  phosphate transporter ATP-binding protein  60.48 
 
 		 272 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.897125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2625  phosphate transporter ATP-binding protein  60.48 
 
 		 272 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0205  phosphate transporter ATP-binding protein  57.92 
 
 		 259 aa  321  9.000000000000001e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2732  phosphate transporter ATP-binding protein  60.48 
 
 		 272 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2811  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.9 
 
 		 261 aa  320  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1536  phosphate transporter ATP-binding protein  61.11 
 
 		 264 aa  320  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.424595  normal  0.394597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0148  phosphate transporter ATP-binding protein  62.1 
 
 		 277 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01640  PstB  59.85 
 
 		 259 aa  320  9.999999999999999e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>