60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3124 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3124  iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 		 149 aa  306  5.9999999999999995e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0313  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2-like protein  76.47 
 
 		 241 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0305  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2-like protein  74.51 
 
 		 241 aa  157  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0153  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  47.83 
 
 		 251 aa  57.4  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0721  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.73 
 
 		 159 aa  51.6  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000221809  normal  0.228333 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1412  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.998302  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0382  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.47 
 
 		 162 aa  50.1  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.248119  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0651  putative ATPase RIL  32.18 
 
 		 592 aa  48.9  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0665  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.72 
 
 		 302 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0678  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.72 
 
 		 302 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000723832 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1298  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2582  iron-sulfur cluster-binding protein; potential subunit of aldehyde oxidoreductase  34.94 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1841  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.48 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000340892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0048  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.94 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2812  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.55 
 
 		 159 aa  47.4  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0501046  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0911  iron-sulfur cluster-binding protein  41.67 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1832  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  47.76 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2851  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.73 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.944597  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1816  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.57 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160939 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1704  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.03 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1079  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.62 
 
 		 241 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1514  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  40.3 
 
 		 442 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3250  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.29 
 
 		 214 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0528  putative ATPase RIL  31.11 
 
 		 590 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2963  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  27.66 
 
 		 658 aa  43.5  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0538  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.33 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.957974  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0560  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.73 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  33.8 
 
 		 273 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1411  hydrogenase 2 protein HybA  39.24 
 
 		 338 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1269  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.25 
 
 		 214 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137493 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3107  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 214 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2533  hydrogenase 2 protein HybA  39.24 
 
 		 338 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.412002  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0524  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.33 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.27641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3653  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.11 
 
 		 307 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00120014  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3097  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 214 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.34 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3689  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.36 
 
 		 659 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02321  hypothetical protein  36.36 
 
 		 659 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1202  glutamate synthase, small subunit  36.36 
 
 		 659 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2280  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.35 
 
 		 226 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000058005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.36 
 
 		 659 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02359  fused predicted oxidoreductase: FeS binding subunit/NAD/FAD-binding subunit  36.36 
 
 		 659 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0139  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.18 
 
 		 258 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.07155  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1256  putative ATPase RIL  30 
 
 		 590 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.811712  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0344  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.82 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0427746  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1380  putative ATPase RIL  30 
 
 		 590 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0776599  normal  0.169573 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2597  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.36 
 
 		 659 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2747  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.36 
 
 		 659 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1209  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.36 
 
 		 659 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2056  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.82 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000895467  hitchhiker  0.00000037707 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0423  dimethylsulfoxide reductase, chain B  36.05 
 
 		 206 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.200964  hitchhiker  0.0000000234498 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0625  hydrogenase, Fe-only  30.43 
 
 		 587 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000144729  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2088  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.96 
 
 		 245 aa  40.8  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000986776  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2923  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.82 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1705  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.5 
 
 		 302 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.295488  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03100  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  29.06 
 
 		 212 aa  40.8  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.688255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1188  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.17 
 
 		 214 aa  40.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2008  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.71 
 
 		 173 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0164  hypothetical protein  38.33 
 
 		 321 aa  40.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0015948  normal  0.315388 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1291  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.16 
 
 		 151 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252517 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>