17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0824 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0824  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  288  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.60854  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1816  hypothetical protein  76.98 
 
 		 148 aa  222  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2457  hypothetical protein  71.74 
 
 		 145 aa  206  7e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3553  hypothetical protein  64.44 
 
 		 153 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0763893  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3028  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  62.32 
 
 		 242 aa  186  9e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000152903  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2853  hypothetical protein  59.29 
 
 		 137 aa  181  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.785345  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1360  hypothetical protein  58.57 
 
 		 137 aa  179  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8054e-20 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0570  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  55.91 
 
 		 243 aa  147  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3430  hypothetical protein  37.5 
 
 		 272 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1086  hypothetical protein  31.09 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4364  SseB family protein  29.52 
 
 		 255 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.606742  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2177  hypothetical protein  27.01 
 
 		 262 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.643513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3651  hypothetical protein  28.23 
 
 		 261 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102237 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1417  hypothetical protein  29.25 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3926  hypothetical protein  29.25 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1481  hypothetical protein  29.25 
 
 		 132 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0589  hypothetical protein  27.21 
 
 		 261 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>