24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3553 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3553  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  318  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0763893  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3028  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  71.53 
 
 
242 aa  214  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000152903  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0824  hypothetical protein  64.44 
 
 
140 aa  187  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.60854  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1816  hypothetical protein  66.92 
 
 
148 aa  181  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0570  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  59.71 
 
 
243 aa  179  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2457  hypothetical protein  66.15 
 
 
145 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1360  hypothetical protein  55.04 
 
 
137 aa  154  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8054e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2853  hypothetical protein  54.26 
 
 
137 aa  152  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.785345  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3430  hypothetical protein  38.85 
 
 
272 aa  104  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3651  hypothetical protein  33.08 
 
 
261 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.102237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0589  hypothetical protein  29.05 
 
 
261 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1086  hypothetical protein  30.77 
 
 
132 aa  47.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2177  hypothetical protein  30 
 
 
262 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.643513  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1481  hypothetical protein  29.25 
 
 
132 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1417  hypothetical protein  29.25 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3926  hypothetical protein  29.25 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1652  hypothetical protein  26.39 
 
 
263 aa  40.8  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.38362 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1288  putative enhancer of serine sensitivity, N-terminal region  28.3 
 
 
132 aa  40.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1455  hypothetical protein  28.3 
 
 
132 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.785741 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1383  hypothetical protein  28.3 
 
 
132 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.072705  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1253  enhancer of serine sensitivity, N-terminal region  28.3 
 
 
132 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0262846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1281  hypothetical protein  28.3 
 
 
132 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1524  hypothetical protein  28.3 
 
 
132 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1255  enhancer of serine sensitivity, N-terminal region  28.3 
 
 
132 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>