14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1816 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1816  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  308  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0824  hypothetical protein  76.98 
 
 		 140 aa  222  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.60854  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2457  hypothetical protein  75 
 
 		 145 aa  215  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1360  hypothetical protein  64.23 
 
 		 137 aa  187  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8054e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2853  hypothetical protein  64.23 
 
 		 137 aa  187  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.785345  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3553  hypothetical protein  66.92 
 
 		 153 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0763893  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3028  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  62.88 
 
 		 242 aa  175  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000152903  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0570  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  54.07 
 
 		 243 aa  145  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3430  hypothetical protein  35.71 
 
 		 272 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3651  hypothetical protein  28.8 
 
 		 261 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102237 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2177  hypothetical protein  26.95 
 
 		 262 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.643513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6083  hypothetical protein  26.39 
 
 		 263 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.3765  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1652  hypothetical protein  25.69 
 
 		 263 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.38362 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1086  hypothetical protein  27.97 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>