16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1360 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1360  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  284  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8054e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2853  hypothetical protein  95.62 
 
 
137 aa  273  6e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.785345  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1816  hypothetical protein  64.23 
 
 
148 aa  187  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0824  hypothetical protein  58.57 
 
 
140 aa  179  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.60854  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2457  hypothetical protein  57.97 
 
 
145 aa  165  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3553  hypothetical protein  55.04 
 
 
153 aa  154  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0763893  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3028  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  55.81 
 
 
242 aa  150  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000152903  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0570  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  51.97 
 
 
243 aa  134  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3430  hypothetical protein  39.26 
 
 
272 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3651  hypothetical protein  29.03 
 
 
261 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.102237 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0603  hypothetical protein  25.98 
 
 
129 aa  47.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0584  hypothetical protein  25.98 
 
 
129 aa  47.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1086  hypothetical protein  31.62 
 
 
132 aa  42.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1417  hypothetical protein  32.77 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3926  hypothetical protein  32.77 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1481  hypothetical protein  30.39 
 
 
132 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>