26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4362 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4362  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  149  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6468  IS4 family transposase  40.51 
 
 
262 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572401  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1566  IS4 family transposase  40.51 
 
 
262 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6412  IS4 family transposase  40.51 
 
 
262 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510008  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4296  putative transposase, IS4  54 
 
 
209 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000110159  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7677  transposase IS4 family protein  37.97 
 
 
247 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2711  putative transposase  54 
 
 
209 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4457  putative transposase  54 
 
 
209 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3510  putative transposase  54 
 
 
209 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.291639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2483  IS4 family transposase  54 
 
 
209 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.929772  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0563  putative IS4 transposase protein B  54 
 
 
209 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.262066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0067  putative transposase IS4  54 
 
 
209 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5785  transposase IS4 family protein  62.16 
 
 
204 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6398  hypothetical protein  54 
 
 
258 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  65.71 
 
 
268 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  65.71 
 
 
268 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4722  IS4 family transposase  50 
 
 
232 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3527  hypothetical protein  60 
 
 
268 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1843  hypothetical protein  60 
 
 
267 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0555  ISJP4 transposase  62.5 
 
 
212 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0733483  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5739  transposase IS4 family protein  71.43 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  47.06 
 
 
268 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3790  transposase, IS4 family protein  42 
 
 
170 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541543  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0847  transposase, IS4 family protein  42 
 
 
170 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.123583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0522  transposase, IS4 family protein  42 
 
 
170 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3504  transposase, IS4 family protein  47.06 
 
 
179 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249811  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>