More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3896 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3092  PhoH family protein  75.7 
 
 		 436 aa  653    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.521905 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1076  PhoH family protein  75.64 
 
 		 441 aa  636    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1057  PhoH family protein  76.1 
 
 		 466 aa  645    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3896  PhoH-like protein  100 
 
 		 430 aa  848    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0954  PhoH family protein  77.05 
 
 		 431 aa  648    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0834  PhoH family protein  93.26 
 
 		 430 aa  795    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.838815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0717  PhoH family protein  77.67 
 
 		 458 aa  649    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8523  PhoH family protein  75.23 
 
 		 447 aa  645    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575031 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4406  PhoH family protein  76.29 
 
 		 457 aa  632  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3128  PhoH family protein  74.88 
 
 		 435 aa  634  1e-180  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.334621  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1665  PhoH family protein  76.11 
 
 		 434 aa  633  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11116  phoH-like protein phoH2 (phosphate starvation-inducible protein psiH)  75.18 
 
 		 433 aa  631  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.664041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0732  PhoH family protein  75.12 
 
 		 444 aa  627  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224346  normal  0.509372 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0102  PhoH family protein  75.12 
 
 		 448 aa  630  1e-179  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1174  PhoH family protein  73.82 
 
 		 480 aa  630  1e-179  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0947  PhoH family protein  73.52 
 
 		 467 aa  624  1e-178  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2062  PhoH family protein  73.43 
 
 		 447 aa  622  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.523979  normal  0.0816593 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4652  PhoH family protein  74 
 
 		 462 aa  622  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.899684 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0457  nucleotide binding protein, PINc  73.65 
 
 		 447 aa  619  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31570  PhoH family protein  73.02 
 
 		 450 aa  619  1e-176  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1245  PhoH family protein  73.82 
 
 		 472 aa  620  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000103809 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0927  PhoH family protein  72.54 
 
 		 444 aa  619  1e-176  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4360  PhoH family protein  73.54 
 
 		 456 aa  614  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4204  PhoH family protein  73.54 
 
 		 456 aa  614  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.050983  normal  0.532301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4129  PhoH-like protein  73.54 
 
 		 456 aa  614  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07310  PhoH family protein  75.94 
 
 		 456 aa  612  9.999999999999999e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.689664  normal  0.875942 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26860  PhoH family protein  71.53 
 
 		 459 aa  596  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.431301  normal  0.750571 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0740  PhoH family protein  70.02 
 
 		 447 aa  585  1e-166  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.72183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1107  PhoH family protein  72.39 
 
 		 460 aa  585  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0810427  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05150  PhoH family protein  69.13 
 
 		 484 aa  578  1e-164  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0712343  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1085  PhoH family protein  74.65 
 
 		 437 aa  579  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23030  PhoH family protein  67.53 
 
 		 436 aa  568  1e-161  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3777  PhoH family protein  37.84 
 
 		 442 aa  279  9e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1866  phoH family protein  38.15 
 
 		 440 aa  277  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.086625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3998  PhoH family protein  37.61 
 
 		 442 aa  277  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.546265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3696  PhoH family protein  37.61 
 
 		 442 aa  277  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3711  PhoH family protein  37.61 
 
 		 442 aa  277  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.512229  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1186  PhoH family protein  37.61 
 
 		 442 aa  277  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.454967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2653  PhoH family protein  38.29 
 
 		 442 aa  277  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.294096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3966  PhoH family protein  37.61 
 
 		 442 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2290  PhoH family protein  38.6 
 
 		 440 aa  277  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4054  PhoH family protein  37.61 
 
 		 442 aa  277  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4070  PhoH family protein  37.39 
 
 		 442 aa  276  4e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00102862  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1302  PhoH-like protein  38.18 
 
 		 439 aa  276  7e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000664986  normal  0.0143296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2311  PhoH family protein  36.28 
 
 		 453 aa  276  8e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.805307  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3863  PhoH family protein  37.61 
 
 		 442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1933  PhoH family protein  38.37 
 
 		 440 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1851  PhoH family ATPase  37.78 
 
 		 438 aa  272  9e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252576  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4161  PhoH family protein  37.36 
 
 		 437 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1848  PhoH family protein  37.5 
 
 		 453 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2521  nucleotide binding protein, PINc  38.34 
 
 		 442 aa  265  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.530709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10930  PhoH family protein  35.99 
 
 		 439 aa  263  4e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2239  PhoH family protein  37.22 
 
 		 441 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.198011 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2374  PhoH family protein  39.1 
 
 		 440 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.833123  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2315  PhoH family protein  37.78 
 
 		 439 aa  261  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.296996  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2286  PhoH family protein  38.88 
 
 		 440 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1577  PhoH-like protein  38.88 
 
 		 440 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0911953  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2494  PhoH family protein  36.36 
 
 		 438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415647  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0609  PhoH family protein  33.93 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.25357  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0022  PhoH family protein  35.12 
 
 		 442 aa  243  3.9999999999999997e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2961  PhoH family protein  34.77 
 
 		 442 aa  241  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00132937  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2279  phoH-related protein  32.66 
 
 		 451 aa  226  8e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.639212 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3602  PhoH family protein  34.65 
 
 		 441 aa  223  7e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000255341  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1543  nucleotide binding protein, PINc  35 
 
 		 462 aa  222  9e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107982  normal  0.828891 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0831  PhoH family protein  33.49 
 
 		 412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0479  PhoH family protein  31.59 
 
 		 410 aa  221  3e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0148  PhoH family protein  32.96 
 
 		 428 aa  217  4e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000131616  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1494  nucleotide binding protein, PINc  34.7 
 
 		 463 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1250  PhoH family protein  33.79 
 
 		 437 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.518978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1304  PhoH-like protein  33.77 
 
 		 457 aa  212  9e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1351  PhoH family protein  31.03 
 
 		 451 aa  211  2e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00120306  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1919  PhoH family protein  30.72 
 
 		 459 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0452134  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2447  PhoH family protein  32.82 
 
 		 442 aa  211  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.115966  normal  0.868134 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1637  PhoH family protein  30.72 
 
 		 459 aa  211  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.169922  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0197  PhoH family protein  37.42 
 
 		 495 aa  210  4e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.213754 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12201  hypothetical protein  32.47 
 
 		 463 aa  209  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3373  PhoH family protein  33.85 
 
 		 446 aa  209  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1323  PhoH family protein  33.33 
 
 		 444 aa  207  3e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1234  PhoH family protein  33.05 
 
 		 494 aa  207  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185488 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0425  PhoH family protein  34.72 
 
 		 418 aa  206  6e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0440  PhoH family protein  34.72 
 
 		 418 aa  206  8e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1396  PhoH family protein  32.7 
 
 		 597 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631064  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0428  PhoH family protein  32.47 
 
 		 548 aa  202  8e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0593193  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1886  PhoH family protein  32.48 
 
 		 544 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.44962  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1159  PhoH family protein  32.48 
 
 		 544 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.613186  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2282  PhoH family protein  32.48 
 
 		 544 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.293655  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0010  PhoH family protein  32.48 
 
 		 544 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0663  PhoH family protein  32.33 
 
 		 469 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.860719  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2407  PhoH family protein  32.48 
 
 		 628 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398735  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2563  PhoH family protein  32.98 
 
 		 587 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388197  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2243  PhoH family protein  32.48 
 
 		 597 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3210  PhoH family protein  32.98 
 
 		 587 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2187  PhoH family protein  32.27 
 
 		 631 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1728  nucleotide binding protein  31.87 
 
 		 465 aa  199  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0561726  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1408  PhoH family protein  32.63 
 
 		 601 aa  200  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.545496  normal  0.312062 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0920  PhoH family protein  32.33 
 
 		 606 aa  199  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115039  normal  0.244887 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1970  PhoH-like protein  32.47 
 
 		 564 aa  199  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.368565  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1469  PhoH family protein  31.81 
 
 		 469 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1185  PhoH family protein  31.81 
 
 		 469 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.940531 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1889  PhoH family protein  32.19 
 
 		 600 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.835175  hitchhiker  0.000000118582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>