More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1223 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1223  cell cycle protein  100 
 
 
371 aa  732    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0943  cell cycle protein  38.67 
 
 
362 aa  228  1e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.596293  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0691  cell cycle protein  34.44 
 
 
364 aa  182  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0715  cell cycle protein  34.9 
 
 
364 aa  180  4e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1974  cell division protein  29.7 
 
 
372 aa  142  7e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  27.58 
 
 
368 aa  142  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  28.18 
 
 
368 aa  142  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3268  cell division protein FtsW  30.41 
 
 
511 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162204  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3257  cell division protein FtsW  30.41 
 
 
511 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19497  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3319  cell division protein FtsW  30.41 
 
 
511 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40135  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0222  cell division protein FtsW  29.48 
 
 
372 aa  140  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0975  stage V sporulation protein E  28.93 
 
 
383 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000101202  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4534  cell division protein FtsW  29.62 
 
 
404 aa  137  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2647  cell division protein FtsW  29.73 
 
 
539 aa  136  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  28.49 
 
 
374 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  28.81 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3290  cell division protein FtsW  29.81 
 
 
374 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4466  cell division protein FtsW  29.91 
 
 
437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1691  cell cycle protein FtsW  32.88 
 
 
403 aa  134  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.951767  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0777  cell division protein FtsW  29.72 
 
 
361 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.968195  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  30 
 
 
379 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  29.14 
 
 
367 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3524  cell division protein FtsW  29.12 
 
 
501 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.336809  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2987  cell division protein FtsW  28.31 
 
 
506 aa  133  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0447497 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2615  cell division protein FtsW  28.91 
 
 
397 aa  133  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000584566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  27.61 
 
 
363 aa  133  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3469  cell division protein FtsW  27.86 
 
 
391 aa  132  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.597104  normal  0.0182976 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0957  cell division protein FtsW  29.68 
 
 
394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.343907 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1073  cell division protein FtsW  28.79 
 
 
416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2869  cell division membrane protein-like protein  28.96 
 
 
441 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488582  normal  0.643206 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  31.16 
 
 
412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  28.82 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0635  cell division protein FtsW  30.13 
 
 
414 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.146996  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0353  cell division protein FtsW  30.23 
 
 
402 aa  130  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000708854 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  29.75 
 
 
374 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0139  cell division protein FtsW  28.94 
 
 
414 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.571731  hitchhiker  0.000000336901 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0139  cell division protein FtsW  28.94 
 
 
414 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.919378 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0136  cell division protein FtsW  28.94 
 
 
414 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.931456 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0144  cell division protein FtsW  28.94 
 
 
414 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0378146  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0143  cell division protein FtsW  28.94 
 
 
414 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.247505 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1130  cell cycle protein  30.99 
 
 
406 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1653  cell cycle protein  33.8 
 
 
366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.948308  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  30.54 
 
 
371 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0671  cell division protein FtsW  29.6 
 
 
381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3805  cell division protein FtsW  28.08 
 
 
404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  29.25 
 
 
373 aa  127  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3812  cell division protein FtsW  28.3 
 
 
405 aa  127  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1146  cell division protein FtsW  27.98 
 
 
406 aa  127  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  30 
 
 
380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  29.48 
 
 
371 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0740  cell division protein FtsW  30.3 
 
 
380 aa  127  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  28.7 
 
 
365 aa  126  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1406  cell division protein FtsW  28.61 
 
 
438 aa  126  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  0.0641122 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2725  cell division protein FtsW  27.96 
 
 
413 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.669489  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3090  cell division protein FtsW  27.96 
 
 
413 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.812659  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3771  cell division protein FtsW  27.22 
 
 
432 aa  125  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.351351  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0486  cell division protein FtsW  28.12 
 
 
403 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2845  cell division FtsW transmembrane protein  28.21 
 
 
413 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  29.73 
 
 
368 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3975  cell division protein FtsW  29.89 
 
 
359 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  28.96 
 
 
379 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  28.96 
 
 
379 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1276  stage V sporulation protein E  33.46 
 
 
374 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2764  rod shape-determining protein RodA  29.31 
 
 
359 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0567  rod shape-determining protein roda  28.45 
 
 
360 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.398514  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  28.87 
 
 
380 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  30 
 
 
367 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2495  cell cycle protein  28.1 
 
 
386 aa  124  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 
369 aa  124  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0896  cell division protein FtsW  29.1 
 
 
476 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.560244  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  29.73 
 
 
367 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3571  cell division protein FtsW  27.36 
 
 
403 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0385  cell division protein FtsW  27.36 
 
 
403 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0110798 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  29.73 
 
 
367 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3454  cell division protein FtsW  29.07 
 
 
404 aa  124  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00477404 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3744  cell division protein FtsW  27.36 
 
 
403 aa  124  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000784985 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0658  cell cycle protein  26.98 
 
 
380 aa  124  4e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  29.43 
 
 
375 aa  124  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  29.36 
 
 
374 aa  124  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  29.73 
 
 
367 aa  124  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5099  cell division protein FtsW  27.19 
 
 
474 aa  123  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00102633  normal  0.0547084 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  28.83 
 
 
372 aa  123  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0768  cell division protein FtsW  28.07 
 
 
400 aa  123  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.626093  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0482  cell division protein FtsW  28.9 
 
 
370 aa  123  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000160421  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  29.28 
 
 
366 aa  123  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0760  cell division protein FtsW  28.91 
 
 
400 aa  122  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.682655  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  32.23 
 
 
366 aa  122  9e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2607  cell division protein FtsW  28.74 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4220  cell division protein FtsW  27.13 
 
 
403 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0322  rod shape-determining protein RodA  29.2 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  31.23 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3129  cell cycle protein  27.44 
 
 
413 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  29.64 
 
 
368 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0409  cell division protein FtsW  27.67 
 
 
410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146554 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1251  cell cycle protein  28.97 
 
 
383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.450877  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3925  cell division protein FtsW  29.66 
 
 
543 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0424202  normal  0.252874 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  29.64 
 
 
368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1485  rod shape-determining protein RodA  30.42 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140754  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  28.66 
 
 
364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2645  cell division protein FtsW  29.43 
 
 
400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>