19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3869 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3869  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  477  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03398  hypothetical protein  99.14 
 
 
232 aa  474  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03349  hypothetical protein  99.14 
 
 
232 aa  474  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4924  hypothetical protein  99.14 
 
 
232 aa  474  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.335605  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4043  hypothetical protein  98.28 
 
 
232 aa  472  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3978  hypothetical protein  98.28 
 
 
232 aa  472  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0164  conserved hypothetical protein  98.28 
 
 
232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0168  putative lipase  98.28 
 
 
232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3750  hypothetical protein  98.28 
 
 
232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3920  putative lipase  73.08 
 
 
234 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.65815 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4024  putative lipase  73.08 
 
 
234 aa  367  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.266935  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3963  putative lipase  73.08 
 
 
234 aa  356  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0770687  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3836  putative lipase  73.08 
 
 
234 aa  356  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.172505  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3855  putative lipase  73.08 
 
 
234 aa  356  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0176  putative lipase  62.82 
 
 
234 aa  308  5.9999999999999995e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.841932  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0065  outer membrane autotransporter  37.33 
 
 
662 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0682  lipase 1  30.43 
 
 
656 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.668862  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0616  lipase 1  30.6 
 
 
656 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0623  lipase 1  30.6 
 
 
656 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>