20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A3891 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3631  transposase family protein  98.54 
 
 		 528 bp  896    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000970076  normal  0.460332 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2215    97.98 
 
 		 507 bp  900    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.896472  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1515    98.38 
 
 		 507 bp  916    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3891    100 
 
 		 522 bp  1035    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1610    98.54 
 
 		 492 bp  892    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2023  IS605 family transposase  98.11 
 
 		 948 bp  874    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2168    97.77 
 
 		 672 bp  890    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01389    98.38 
 
 		 507 bp  916    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0022    98.37 
 
 		 431 bp  787    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2228    98.36 
 
 		 426 bp  789    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.646307 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2032  IS605 family transposase  95.66 
 
 		 501 bp  605  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1063  hypothetical protein  98.69 
 
 		 153 bp  287  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000559213  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4239    96.41 
 
 		 171 bp  283  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2551  hypothetical protein  97.45 
 
 		 156 bp  272  8.999999999999999e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000283531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4189  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 894 bp  65.9  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03507  hypothetical protein  100 
 
 		 924 bp  65.9  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.702446  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0023  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 894 bp  65.9  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  100 
 
 		 924 bp  65.9  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5113  transcriptional regulator, AraC family  96.97 
 
 		 894 bp  58  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.52445 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4046  AraC family transcriptional regulator  96.77 
 
 		 894 bp  54  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>