15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2228 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01389    100 
 
 		 507 bp  844    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2215    99.53 
 
 		 507 bp  829    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.896472  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1515    100 
 
 		 507 bp  844    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3891    98.36 
 
 		 522 bp  789    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1610    99.51 
 
 		 492 bp  799    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2023  IS605 family transposase  99.27 
 
 		 948 bp  791    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2168    99.06 
 
 		 672 bp  813    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0022    97.65 
 
 		 431 bp  757    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2228    100 
 
 		 426 bp  844    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.646307 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3631  transposase family protein  97.8 
 
 		 528 bp  741    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000970076  normal  0.460332 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2032  IS605 family transposase  95.39 
 
 		 501 bp  597  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4239    98.21 
 
 		 171 bp  309  3e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2551  hypothetical protein  98.73 
 
 		 156 bp  287  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000283531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1063  hypothetical protein  98.69 
 
 		 153 bp  287  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000559213  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  86.79 
 
 		 417 bp  50.1  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>