14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4239 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4239    100 
 
 		 171 bp  339  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1610    99.4 
 
 		 492 bp  325  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01389    98.21 
 
 		 507 bp  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1515    98.21 
 
 		 507 bp  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2228    98.21 
 
 		 426 bp  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.646307 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2215    97.62 
 
 		 507 bp  301  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.896472  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2168    97.62 
 
 		 672 bp  301  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2023  IS605 family transposase  97.56 
 
 		 948 bp  293  8e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0022    97.06 
 
 		 431 bp  289  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3891    96.41 
 
 		 522 bp  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3631  transposase family protein  96.41 
 
 		 528 bp  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000970076  normal  0.460332 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2032  IS605 family transposase  94.61 
 
 		 501 bp  260  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1063  hypothetical protein  99.14 
 
 		 153 bp  222  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000559213  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2551  hypothetical protein  97.5 
 
 		 156 bp  206  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000283531  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>