13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_F0084 on replicon NC_009786
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009786  EcE24377A_F0084    100 
 
 		 1107 bp  2194    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0145229  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0010  IS91, transposase, truncation  92.05 
 
 		 855 bp  1088    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0100  IS91 ORF  92.33 
 
 		 1233 bp  1469    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0063    90.04 
 
 		 746 bp  589  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.447808  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0067    90.04 
 
 		 746 bp  589  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0097  transposase  93.83 
 
 		 510 bp  484  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0413363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0030    88.15 
 
 		 402 bp  299  9e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0210    88.15 
 
 		 402 bp  299  9e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0095  hypothetical protein  93.2 
 
 		 222 bp  297  4e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0134415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0096  ISSd1, transposase OrfB  95.27 
 
 		 735 bp  272  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00302265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0008  IS91, transposase, truncation  91.07 
 
 		 174 bp  143  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0077  IS1414, transposase, truncation  100 
 
 		 285 bp  79.8  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.829264  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0727  hypothetical protein  100 
 
 		 432 bp  75.8  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>