11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0030 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0030    100 
 
 		 402 bp  797    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0210    99.5 
 
 		 402 bp  781    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0084    88.15 
 
 		 1107 bp  299  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0145229  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0100  IS91 ORF  87.5 
 
 		 1233 bp  293  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0010  IS91, transposase, truncation  87.16 
 
 		 855 bp  285  5.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0063    86.06 
 
 		 746 bp  145  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.447808  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0067    86.06 
 
 		 746 bp  145  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0097  transposase  91 
 
 		 510 bp  127  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0413363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0031  IS91 orf  100 
 
 		 186 bp  91.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0211    97.83 
 
 		 282 bp  83.8  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0095  hypothetical protein  89.58 
 
 		 222 bp  56  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0134415  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>