10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_F0063 on replicon NC_009786
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009786  EcE24377A_F0063    100 
 
 		 746 bp  1479    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.447808  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0067    100 
 
 		 746 bp  1479    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0100  IS91 ORF  92.74 
 
 		 1233 bp  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0084    90.04 
 
 		 1107 bp  589  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0145229  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0097  transposase  91.98 
 
 		 510 bp  436  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0413363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0010  IS91, transposase, truncation  92.22 
 
 		 855 bp  351  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0096  ISSd1, transposase OrfB  94.67 
 
 		 735 bp  264  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00302265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0008  IS91, transposase, truncation  95.65 
 
 		 174 bp  188  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0030    86.06 
 
 		 402 bp  145  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0210    86.06 
 
 		 402 bp  145  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>