23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3133 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3133  type VI secretion lipoprotein  100 
 
 		 127 aa  259  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1802  hypothetical protein  47.97 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.56234  normal  0.0484163 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2995  hypothetical protein  44.07 
 
 		 193 aa  99  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000478166 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2487  hypothetical protein  44.07 
 
 		 193 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2585  hypothetical protein  43.22 
 
 		 193 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.788173  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0802  hypothetical protein  42.37 
 
 		 193 aa  94  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3243  hypothetical protein  38.05 
 
 		 178 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.795372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3659  hypothetical protein  34.19 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177991  normal  0.259907 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5275  hypothetical protein  28.93 
 
 		 212 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.174651  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0637  hypothetical protein  28.44 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2376  hypothetical protein  30.85 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42940  putative lipoprotein  23.08 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.177757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3606  putative lipoprotein  23.08 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1116  putative type VI secretion protein VasD  24.79 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5421  lipoprotein, putative  24.04 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2628  hypothetical protein  29 
 
 		 240 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.189737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0101  hypothetical protein  22.55 
 
 		 160 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5580  putative lipoprotein  23.38 
 
 		 166 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02043  lipoprotein, putative  23 
 
 		 202 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3094  hypothetical protein  29 
 
 		 240 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518827  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2504  putative lipoprotein  28.28 
 
 		 240 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2770  hypothetical protein  28 
 
 		 240 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124762  normal  0.552799 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1595  hypothetical protein  27.47 
 
 		 171 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204412  normal  0.501762 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>