25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03879 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012892  B21_03832  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  289  8e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149166  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03879  Zn-binding periplasmic protein  100 
 
 		 139 aa  289  8e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4023  zinc resistance protein  100 
 
 		 139 aa  289  8e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62288  normal  0.0161925 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3992  zinc resistance-associated protein  100 
 
 		 141 aa  244  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5471  zinc resistance protein  100 
 
 		 141 aa  244  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.465059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4236  zinc resistance protein  100 
 
 		 141 aa  244  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4545  zinc resistance protein  100 
 
 		 141 aa  244  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.104922  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4493  zinc resistance protein  100 
 
 		 188 aa  244  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00866025  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4450  zinc resistance protein  96.64 
 
 		 139 aa  239  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.353323  hitchhiker  0.00183369 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4503  zinc resistance protein  64.57 
 
 		 151 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456062  normal  0.0778216 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4505  zinc resistance protein  64.57 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0271972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4383  zinc resistance protein  64.57 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.882524 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4416  zinc resistance protein  64.57 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.023002  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4579  zinc resistance protein  64.57 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.648848 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2822  zinc resistance protein  46.46 
 
 		 157 aa  88.2  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2909  zinc resistance protein  45.45 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457482  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0425  zinc-resistance associated protein  34.13 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000113205  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0927  hypothetical protein  29.5 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000237376  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0429  zinc-resistance associated protein  28 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2945  hypothetical protein  32.05 
 
 		 175 aa  47.8  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2711  hypothetical protein  28.04 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1711  hypothetical protein  29 
 
 		 173 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.43273e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0765  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.221597  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1805  hypothetical protein  26.15 
 
 		 217 aa  41.2  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2809  hypothetical protein  31.96 
 
 		 160 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00265973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>