24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1711 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1711  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  350  5.9999999999999994e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.43273e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2945  hypothetical protein  37.04 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0015  zinc resistance-associated protein  28.23 
 
 		 173 aa  52  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.893884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0765  hypothetical protein  35.77 
 
 		 176 aa  48.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.221597  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2809  hypothetical protein  30.51 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00265973  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2711  hypothetical protein  28.95 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4579  zinc resistance protein  29.17 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.648848 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4416  zinc resistance protein  29.17 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.023002  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4505  zinc resistance protein  29.17 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0271972 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4503  zinc resistance protein  29.63 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456062  normal  0.0778216 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4383  zinc resistance protein  29.17 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.882524 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0111  zinc resistance-associated protein  30.95 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0927  hypothetical protein  21.74 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000237376  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3992  zinc resistance-associated protein  24.56 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03832  hypothetical protein  24.56 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5471  zinc resistance protein  24.56 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.465059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4493  zinc resistance protein  24.56 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00866025  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4023  zinc resistance protein  24.56 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62288  normal  0.0161925 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4545  zinc resistance protein  24.56 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.104922  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4236  zinc resistance protein  24.56 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03879  Zn-binding periplasmic protein  24.56 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0425  zinc-resistance associated protein  34.88 
 
 		 123 aa  42  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000113205  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2819  hypothetical protein  28.23 
 
 		 238 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1805  hypothetical protein  24.6 
 
 		 217 aa  40.8  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>