15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0765 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0765  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  354  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.221597  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2945  hypothetical protein  37.19 
 
 
175 aa  64.3  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2822  zinc resistance protein  32.73 
 
 
157 aa  52  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2909  zinc resistance protein  32.12 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457482  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4493  zinc resistance protein  29.84 
 
 
188 aa  45.4  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00866025  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1805  hypothetical protein  27.27 
 
 
217 aa  45.4  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03879  Zn-binding periplasmic protein  29.84 
 
 
139 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3992  zinc resistance-associated protein  29.84 
 
 
141 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1711  hypothetical protein  36.08 
 
 
173 aa  44.3  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.43273e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4236  zinc resistance protein  29.84 
 
 
141 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4545  zinc resistance protein  29.84 
 
 
141 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.104922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4023  zinc resistance protein  29.84 
 
 
139 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62288  normal  0.0161925 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5471  zinc resistance protein  29.84 
 
 
141 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.465059  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03832  hypothetical protein  29.84 
 
 
139 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149166  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0015  zinc resistance-associated protein  33.86 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.893884  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>