24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4503 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4503  zinc resistance protein  100 
 
 
151 aa  310  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456062  normal  0.0778216 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4579  zinc resistance protein  99.34 
 
 
151 aa  306  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.648848 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4416  zinc resistance protein  99.34 
 
 
151 aa  306  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.023002  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4383  zinc resistance protein  99.34 
 
 
151 aa  306  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.882524 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4505  zinc resistance protein  99.34 
 
 
151 aa  306  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0271972 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3992  zinc resistance-associated protein  63.2 
 
 
141 aa  160  6e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5471  zinc resistance protein  63.2 
 
 
141 aa  160  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.465059  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4236  zinc resistance protein  63.2 
 
 
141 aa  160  6e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4545  zinc resistance protein  63.2 
 
 
141 aa  160  6e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.104922  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4493  zinc resistance protein  63.2 
 
 
188 aa  160  6e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00866025  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03832  hypothetical protein  63.57 
 
 
139 aa  159  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149166  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03879  Zn-binding periplasmic protein  63.57 
 
 
139 aa  159  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4023  zinc resistance protein  63.57 
 
 
139 aa  159  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62288  normal  0.0161925 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4450  zinc resistance protein  62.02 
 
 
139 aa  157  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.353323  hitchhiker  0.00183369 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2822  zinc resistance protein  36.02 
 
 
157 aa  87.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2909  zinc resistance protein  35.4 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457482  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2945  hypothetical protein  34.58 
 
 
175 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0429  zinc-resistance associated protein  30.71 
 
 
157 aa  55.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0425  zinc-resistance associated protein  30.71 
 
 
123 aa  56.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000113205  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0927  hypothetical protein  30.1 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000237376  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1711  hypothetical protein  29.35 
 
 
173 aa  48.9  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.43273e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0015  zinc resistance-associated protein  31.86 
 
 
173 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.893884  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2809  hypothetical protein  27.63 
 
 
160 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00265973  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3689  hypothetical protein  32.26 
 
 
129 aa  40.4  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>