25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0429 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0429  zinc-resistance associated protein  100 
 
 		 157 aa  322  1e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0927  hypothetical protein  37.01 
 
 		 153 aa  91.7  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000237376  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2822  zinc resistance protein  33.11 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2909  zinc resistance protein  32.43 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457482  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3689  hypothetical protein  30.67 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4493  zinc resistance protein  28 
 
 		 188 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00866025  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3992  zinc resistance-associated protein  28 
 
 		 141 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03832  hypothetical protein  28 
 
 		 139 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5471  zinc resistance protein  28 
 
 		 141 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.465059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4023  zinc resistance protein  28 
 
 		 139 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62288  normal  0.0161925 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4545  zinc resistance protein  28 
 
 		 141 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.104922  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4236  zinc resistance protein  28 
 
 		 141 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03879  Zn-binding periplasmic protein  28 
 
 		 139 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1014  zinc resistance-associated protein  31.45 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00638164  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0425  zinc-resistance associated protein  32.89 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000113205  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4450  zinc resistance protein  27.2 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.353323  hitchhiker  0.00183369 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2809  hypothetical protein  26.49 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00265973  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2143  hypothetical protein  28.95 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2931  hypothetical protein  31.94 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971086  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1711  hypothetical protein  31.13 
 
 		 173 aa  41.2  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.43273e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4503  zinc resistance protein  29.63 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456062  normal  0.0778216 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4505  zinc resistance protein  29.63 
 
 		 151 aa  40.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0271972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4383  zinc resistance protein  29.63 
 
 		 151 aa  40.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.882524 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4416  zinc resistance protein  29.63 
 
 		 151 aa  40.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.023002  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4579  zinc resistance protein  29.63 
 
 		 151 aa  40.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.648848 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>