16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0425 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0425  zinc-resistance associated protein  100 
 
 
123 aa  260  4e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000113205  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4450  zinc resistance protein  36.27 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.353323  hitchhiker  0.00183369 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4493  zinc resistance protein  36.27 
 
 
188 aa  57.4  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00866025  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03879  Zn-binding periplasmic protein  36.27 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3992  zinc resistance-associated protein  36.27 
 
 
141 aa  57  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4236  zinc resistance protein  36.27 
 
 
141 aa  57  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4545  zinc resistance protein  36.27 
 
 
141 aa  57  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.104922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4023  zinc resistance protein  36.27 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62288  normal  0.0161925 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5471  zinc resistance protein  36.27 
 
 
141 aa  57  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.465059  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03832  hypothetical protein  36.27 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149166  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4505  zinc resistance protein  31.03 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0271972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4383  zinc resistance protein  31.03 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.882524 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4416  zinc resistance protein  31.03 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.023002  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4579  zinc resistance protein  31.03 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.648848 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4503  zinc resistance protein  35.48 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456062  normal  0.0778216 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1711  hypothetical protein  31.94 
 
 
173 aa  40.4  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.43273e-19  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>