89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01914 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2291  exonuclease I  93.16 
 
 		 476 aa  922    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.057719 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2627  exonuclease I  84.4 
 
 		 476 aa  848    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0145209  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2420  exonuclease I  73.26 
 
 		 476 aa  744    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2149  exonuclease I  98.95 
 
 		 475 aa  983    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2302  exonuclease I  98.95 
 
 		 475 aa  982    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3214  exonuclease I  69.07 
 
 		 475 aa  702    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.650627  normal  0.0240807 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3083  exonuclease I  72.69 
 
 		 487 aa  741    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2516  exonuclease I  73.26 
 
 		 476 aa  744    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1629  exonuclease I  99.16 
 
 		 475 aa  985    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.186939 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1049  exonuclease I  97.68 
 
 		 475 aa  968    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.106186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1221  exonuclease I  98.95 
 
 		 475 aa  983    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.171451  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2244  exonuclease I  92.95 
 
 		 476 aa  920    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0792988 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2293  exonuclease I  92.74 
 
 		 476 aa  919    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.083506 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2191  exonuclease I  92.95 
 
 		 476 aa  920    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.343372  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2404  exonuclease I  92.95 
 
 		 476 aa  920    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.191485 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2944  exonuclease I  98.1 
 
 		 474 aa  970    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000391872 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2211  exonuclease I  70.32 
 
 		 476 aa  713    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01900  hypothetical protein  100 
 
 		 475 aa  990    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2313  exonuclease I  68.84 
 
 		 476 aa  699    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1762  exonuclease I  74.31 
 
 		 475 aa  734    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.303406  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2034  exonuclease I  74.1 
 
 		 475 aa  735    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01914  exonuclease I  100 
 
 		 475 aa  990    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1646  Exodeoxyribonuclease I  99.16 
 
 		 475 aa  985    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003696  exodeoxyribonuclease I  60.17 
 
 		 473 aa  596  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02119  exonuclease I  59.96 
 
 		 473 aa  596  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0855  exonuclease I  58.72 
 
 		 474 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0872  exonuclease I  55.77 
 
 		 486 aa  555  1e-157  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.759367  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1680  exonuclease I  54.6 
 
 		 474 aa  546  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2617  exonuclease I  52.8 
 
 		 470 aa  509  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.13081  hitchhiker  0.0000541191 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2487  exonuclease I  53.4 
 
 		 470 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2049  exonuclease I  52.47 
 
 		 470 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0380557  normal  0.0388906 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2014  exonuclease I  52.59 
 
 		 487 aa  507  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.516095  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1611  exonuclease I  53.98 
 
 		 482 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010565 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1973  exonuclease I  52.98 
 
 		 470 aa  500  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.464064  hitchhiker  0.00304849 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1695  exonuclease I  52.84 
 
 		 472 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.856204  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1680  exonuclease I  52.63 
 
 		 472 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1717  exonuclease I  52.63 
 
 		 472 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.25005 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2662  exonuclease I  52.42 
 
 		 470 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00905803  hitchhiker  0.00509909 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2287  exonuclease I  51.81 
 
 		 470 aa  497  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2572  exonuclease I  52.26 
 
 		 470 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.731492  normal  0.440521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2480  exonuclease I  52.25 
 
 		 470 aa  491  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1569  exonuclease I  52.03 
 
 		 470 aa  490  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.856222  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2410  exonuclease I  52.03 
 
 		 470 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.210191  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2790  exonuclease I  52.04 
 
 		 470 aa  487  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1638  exonuclease I  48.95 
 
 		 473 aa  484  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.073476  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2172  exodeoxyribonuclease I  49.05 
 
 		 476 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.585102  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2436  exodeoxyribonuclease I  49.89 
 
 		 486 aa  468  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152961  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02405  exodeoxyribonuclease I  47.36 
 
 		 478 aa  455  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.365933  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3024  exonuclease I  48.85 
 
 		 495 aa  444  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.377058  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38320  exonuclease I  48.32 
 
 		 476 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322615  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56080  exonuclease I  50.83 
 
 		 480 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4884  exonuclease I  50 
 
 		 478 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3314  exonuclease I  50.23 
 
 		 481 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4438  exonuclease I  47.77 
 
 		 476 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1005  exonuclease I  49.29 
 
 		 478 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000425826  hitchhiker  0.00000000000101458 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2602  exonuclease I  46.23 
 
 		 482 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0809104  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4316  exodeoxyribonuclease I  50.35 
 
 		 476 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.117686  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4359  exonuclease I  49.07 
 
 		 477 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000903496  normal  0.0362727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1365  exonuclease I  49.88 
 
 		 477 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0498448  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2394  exonuclease I  43.71 
 
 		 485 aa  413  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869913 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4449  exonuclease I  49.17 
 
 		 477 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484535  hitchhiker  0.0000188223 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2380  exodeoxyribonuclease I  43.67 
 
 		 484 aa  411  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3405  exonuclease I  46.12 
 
 		 479 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.117362 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3059  exonuclease I  45.49 
 
 		 479 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3125  exonuclease I  45.17 
 
 		 477 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2653  exonuclease I  46.23 
 
 		 479 aa  401  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.837858  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4020  exonuclease I  49.52 
 
 		 476 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.036552  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3505  exonuclease I  44.7 
 
 		 479 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00584521  normal  0.826797 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2072  exonuclease I  44.95 
 
 		 485 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0682352  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1360  exonuclease I  44.65 
 
 		 479 aa  394  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1689  exonuclease I  45.7 
 
 		 479 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3236  exonuclease I  46.06 
 
 		 478 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537187  normal  0.286488 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1935  exonuclease I  45.95 
 
 		 482 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1838  exonuclease I  45.91 
 
 		 479 aa  391  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0510838  normal  0.42873 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2939  exonuclease I  44.91 
 
 		 480 aa  386  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.66947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00762  exonuclease I  44.11 
 
 		 481 aa  385  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.485604  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2713  exonuclease I  44.47 
 
 		 484 aa  387  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0303848 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2382  exonuclease I  43.86 
 
 		 478 aa  386  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0837  exonuclease I  42.92 
 
 		 478 aa  372  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0954  exonuclease I  42.71 
 
 		 488 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.364121  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2600  exonuclease I  43.97 
 
 		 479 aa  358  9e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.186824  normal  0.262896 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0266  exonuclease I  43.24 
 
 		 481 aa  348  1e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1071  Exodeoxyribonuclease I  35.71 
 
 		 495 aa  288  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1822  exodeoxyribonuclease I  27.5 
 
 		 468 aa  144  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1518  exonuclease  30.56 
 
 		 458 aa  133  6e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1451  exodeoxyribonuclease I  30.56 
 
 		 458 aa  133  6.999999999999999e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0928  hypothetical protein  24.15 
 
 		 228 aa  45.8  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1051  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.32 
 
 		 189 aa  45.8  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.925098  hitchhiker  0.00013218 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0426  helicase, UvrD/REP/exonuclease family protein  24.1 
 
 		 870 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>