22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00615 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2977  heat shock protein DnaJ domain protein  98.42 
 
 		 483 aa  771    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00615  Hsc56 co-chaperone of HscC  100 
 
 		 379 aa  780    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0600  DnaJ domain protein  98.15 
 
 		 483 aa  766    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0677  DnaJ domain-containing protein  97.63 
 
 		 483 aa  766    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2996  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  98.42 
 
 		 483 aa  771    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0670  DnaJ domain-containing protein  96.31 
 
 		 483 aa  759    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0701  DnaJ domain protein  51.79 
 
 		 487 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.144664  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0775  DnaJ domain-containing protein  51.91 
 
 		 490 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.953726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0715  DnaJ domain protein  51.65 
 
 		 490 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0762  DnaJ domain-containing protein  51.4 
 
 		 490 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0667  DnaJ domain-containing protein  45.91 
 
 		 475 aa  315  8e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.910417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0674  DnaJ domain-containing protein  45.38 
 
 		 475 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.695624  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2999  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.12 
 
 		 475 aa  305  7e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2980  heat shock protein DnaJ domain protein  45.12 
 
 		 475 aa  305  7e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0736  DnaJ domain protein  44.85 
 
 		 475 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.726449 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0699  DnaJ domain protein  41.33 
 
 		 477 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145926  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0713  DnaJ domain protein  41.87 
 
 		 477 aa  285  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0805065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0773  DnaJ domain-containing protein  41.33 
 
 		 477 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0760  DnaJ domain-containing protein  41.07 
 
 		 477 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.504054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1885  heat shock protein DnaJ-like  27.4 
 
 		 901 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4474  heat shock protein DnaJ domain protein  25.39 
 
 		 909 aa  73.2  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4189  heat shock protein DnaJ domain protein  26.82 
 
 		 909 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>