More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0683 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0683  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 424 aa  844    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.422989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1008  aminotransferase class I and II  50.7 
 
 		 446 aa  324  2e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.899799 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2662  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.46 
 
 		 385 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3712  aminotransferase, class I and II  41.67 
 
 		 385 aa  293  3e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.040259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1118  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.32 
 
 		 384 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.721957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4187  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.99 
 
 		 395 aa  196  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3949  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.12 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2838  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.3 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1009  8-amino-7-oxononanoate synthase  30 
 
 		 395 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3873  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.9 
 
 		 395 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2429  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.91 
 
 		 388 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4228  8-amino-7-oxononanoate synthase  30 
 
 		 395 aa  190  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.323305  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3859  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.78 
 
 		 395 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0031  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.25 
 
 		 395 aa  188  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4141  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.43 
 
 		 395 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4026  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.43 
 
 		 395 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4339  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.43 
 
 		 395 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2069  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.09 
 
 		 388 aa  187  4e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4251  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.73 
 
 		 394 aa  186  9e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0113  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.24 
 
 		 394 aa  184  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4686  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.53 
 
 		 396 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0079  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.89 
 
 		 394 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0495  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.76 
 
 		 396 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.17 
 
 		 390 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.74 
 
 		 395 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2457  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.82 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.27 
 
 		 390 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6894  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.9 
 
 		 399 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  29.78 
 
 		 388 aa  170  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2897  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.91 
 
 		 387 aa  168  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786658  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2093  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.49 
 
 		 391 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2189  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.14 
 
 		 388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0613  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.97 
 
 		 393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1662  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.68 
 
 		 391 aa  166  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0317  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.81 
 
 		 385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.76 
 
 		 390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5175  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.18 
 
 		 392 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701145  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0680  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.5 
 
 		 385 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2100  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.13 
 
 		 386 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.67 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1130  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.06 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  28.25 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1195  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.01 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.760383 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.24 
 
 		 401 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.24 
 
 		 401 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.12 
 
 		 396 aa  159  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0419  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.39 
 
 		 389 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014037 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1665  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.45 
 
 		 390 aa  158  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000158621  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0243  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.39 
 
 		 389 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4834  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.3 
 
 		 380 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348424 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.54 
 
 		 383 aa  156  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.68 
 
 		 391 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01808  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.24 
 
 		 383 aa  157  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0320  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.86 
 
 		 386 aa  156  6e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569428  normal  0.0137609 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.84 
 
 		 391 aa  156  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1979  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.47 
 
 		 397 aa  156  8e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3456  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.02 
 
 		 403 aa  155  9e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0094566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2441  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.11 
 
 		 382 aa  155  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0723004  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0363  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.26 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.41 
 
 		 396 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.58 
 
 		 389 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4087  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.83 
 
 		 389 aa  155  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0351  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.91 
 
 		 380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0240485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.33 
 
 		 389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.59 
 
 		 394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0065  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.65 
 
 		 381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00162329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0448  aminotransferase class I and II  28.96 
 
 		 428 aa  154  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.341482  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0423  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.34 
 
 		 384 aa  154  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  29.64 
 
 		 395 aa  154  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1326  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.58 
 
 		 384 aa  154  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0328  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.91 
 
 		 380 aa  154  4e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.971003  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0067  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.65 
 
 		 381 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2068  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.25 
 
 		 387 aa  153  5e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05990  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.59 
 
 		 391 aa  153  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  26.04 
 
 		 395 aa  153  7e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0142  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.44 
 
 		 407 aa  153  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0560736 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1910  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.52 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0799  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.81 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000322202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1166  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.72 
 
 		 386 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.609374  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1570  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.58 
 
 		 501 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.537635  normal  0.306191 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2538  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.26 
 
 		 384 aa  150  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00272507  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00743  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.55 
 
 		 384 aa  150  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0819  8-amino-7-oxononanoate synthase  25.89 
 
 		 374 aa  150  5e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.11779 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0924  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.55 
 
 		 384 aa  150  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00304993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00760  hypothetical protein  31.55 
 
 		 384 aa  150  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00012618  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0830  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.55 
 
 		 384 aa  150  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2867  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.55 
 
 		 384 aa  150  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00148387  normal  0.0589709 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0804  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30.1 
 
 		 402 aa  149  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145956  normal  0.0180987 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0077  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  29.25 
 
 		 399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0554618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0839  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.79 
 
 		 384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000113881  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3954  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.37 
 
 		 398 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0183173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2576  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.53 
 
 		 384 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828217  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  25.97 
 
 		 393 aa  147  4.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16481  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  27.79 
 
 		 381 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2866  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.55 
 
 		 384 aa  147  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000062905  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1470  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.84 
 
 		 402 aa  146  6e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.000728084  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0039  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.82 
 
 		 395 aa  146  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  25.91 
 
 		 391 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0088  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.12 
 
 		 398 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4121  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.12 
 
 		 398 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.54608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>